Wilcoxon检验中使用数据的误差

Question

我在试着做Wilcoxon测试。基本上，我从csv文件中读取数据和标签，如下代码所示：

fmeasures <- read.csv(file="fmeasures.txt",head=FALSE,sep=",")
labels <- read.csv(file="labels.txt",head=FALSE,sep=",")

然后，我用下面的一行应用Wilcoxon检验

pairwise.wilcox.test(fmeasures, labels, p.adj = "bonf", paired= TRUE)

我有以下错误：

Error in sort.list(y) : 'x' must be atomic for 'sort.list'
Have you called 'sort' on a list?
Calls: pairwise.wilcox.test -> factor -> as.factor -> factor ->   sort.list
Execution halted

顺便说一下，标签是一个字符串数组。

标签文件为这里，f测量文件为这里。

这是怎么回事？我怎么才能解决这个问题？

Answer 1

问题是，通过从调用中读取labels.txt，您将得到一个包含170个列的data.frame。试一试：

pairwise.wilcox.test(fmeasures, unlist(labels), p.adj = "bonf", paired= TRUE)

您可以看到，str(unlist(labels))是17个级别的一个因素：

#Factor w/ 17 levels "dct","hierarch_sift",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
#- attr(*, "names")= chr [1:170] "V1" "V2" "V3" "V4" ...

编辑：

为了完整起见，需要将fmeasures转换为数字向量，因为read.csv()原始调用给出的结果与labels.txt (有170列的data.frame )的结果相同。因此，一个完整的解决办法是：

pairwise.wilcox.test(as.numeric(fmeasures), unlist(labels), p.adj = "bonf", paired= TRUE)