Python:追加行后的列表不正确

Question

我试图将行添加到从文件中读取的空列表中，并且已经删除了返回行和换行符，但是一行应该作为两个单独的项输入到列表中。

DNA = open('DNAGCex.txt')
DNAID = []
DNASEQ = []
for line in DNA:
    line = line.rstrip()
    line = line.lstrip()
    if line.startswith('>')==True:
        DNAID.append(line)
    if line.startswith('>')==False:
        DNASEQ.append(line)
print DNAID
print DNASEQ

这是输出

'>Rosalind_6404'，'>Rosalind_5959'，'>Rosalind_0808‘

我想让它看起来像这样

'>Rosalind_6404'，'>Rosalind_5959'，'>Rosalind_0808‘

这是来源材料，只需删除“s”：

“>Rosalind_6404”CCTGCGGAAGATCGGCACTAGA '>Rosalind_5959‘CCTGCGGAAGATCGGCACTAGA '>Rosalind_0808’

Answer 1

您可以将.lstrip()和.rstrip()组合成一个.strip()调用。

然后，您会认为.append()将行添加到列表中，并将行连接到一行中。在这里，我们使用空字符串启动DNASEQ，并使用+=将行连接到一个长字符串中：

DNA = open('DNAGCex.txt')
DNAID = []
DNASEQ = []
for line in DNA:
    line = line.strip()
    if line.startswith('>'):
        DNAID.append(line)
        DNASEQ.append('')
    else:
        DNASEQ[-1] += line
print DNAID
print DNASEQ

Answer 2

在循环的每一次迭代中，您只查看文件中的某一行。这意味着，虽然您确实是在追加末尾不包含linefeed的行，但您仍然在一次追加文件的一个行。您必须让解释器知道您希望合并某些行，方法是在第一次开始在DNASEQ中阅读时设置一个标志，并在下一个DNAID开始时清除它。

for line in DNA:
    line = line.strip() # gets both sides
    if line.startswith('>'):
        starting = True
        DNAID.append(line)
    elif starting:
        starting = False
        DNASEQ.append(line)
    else:
        DNASEQ[-1] += line