广义线性模型的文本输出

Question

我可以使用texreg获得用于knitr的glm的漂亮输出。有时我们需要用反向链接将glm的输出转换回响应。我想知道如何使用texreg获得反向链接输出。有点像texreg(exp(glm.D93))。

counts <- c(18,17,15,20,10,20,25,13,12)
outcome <- gl(3,1,9)
treatment <- gl(3,3)
d.AD <- data.frame(treatment, outcome, counts)
glm.D93 <- glm(counts ~ outcome + treatment, family = poisson())

library(texreg)
texreg(glm.D93)

产

\begin{table}
\begin{center}
\begin{tabular}{l c }
\hline
               & Model 1 \\
\hline
(Intercept)    & $3.04^{***}$ \\
               & $(0.17)$     \\
outcome2       & $-0.45^{*}$  \\
               & $(0.20)$     \\
outcome3       & $-0.29$      \\
               & $(0.19)$     \\
treatment2     & $0.00$       \\
               & $(0.20)$     \\
treatment3     & $0.00$       \\
               & $(0.20)$     \\
\hline
AIC            & 56.76        \\
BIC            & 57.75        \\
Log Likelihood & -23.38       \\
Deviance       & 5.13         \\
Num. obs.      & 9            \\
\hline
\multicolumn{2}{l}{\scriptsize{$^{***}p<0.001$, $^{**}p<0.01$, $^*p<0.05$}}
\end{tabular}
\caption{Statistical models}
\label{table:coefficients}
\end{center}
\end{table}

但texreg(exp(glm.D93))说

Error in exp(glm.D93) : non-numeric argument to mathematical function

编辑的

glm使用了一些link函数，并提供了标准错误、和置信区间 on 链接标度。但有时我们也需要coefficients，，，标准错误，和置信区间的响应等级。coefficients，直接提供coefficients，标准错误和置信区间在链路标度上，不知道是否有可能直接得到标准错误和E 141置信区间E 242对E 143响应标度E 244。

我找到了一种在stargazer中实现这一目标的方法，但是标准错误和置信区间仍然不是正确的。寻找解决这个问题的方法。

library(stargazer)

stargazer(glm.D93, coef=list(exp(glm.D93$coefficients)), type="text")

=============================================
                      Dependent variable:    
                  ---------------------------
                            counts           
---------------------------------------------
outcome2                   0.635***          
                            (0.202)          

outcome3                   0.746***          
                            (0.193)          

treatment2                 1.000***          
                            (0.200)          

treatment3                 1.000***          
                            (0.200)          

Constant                   21.000***         
                            (0.171)          

---------------------------------------------
Observations                   9             
Log Likelihood              -23.381          
Akaike Inf. Crit.           56.761           
=============================================
Note:             *p<0.1; **p<0.05; ***p<0.01

Answer 1

要么使用覆盖参数来完成这一任务，要么操作中间的texreg对象：

# solution 1
tr <- extract(glm.D93)
texreg(glm.D93, override.coef = exp(tr@coef), override.se = exp(tr@se))

# solution 2
tr <- extract(glm.D93)
tr@coef <- exp(tr@coef)
tr@se <- exp(tr@se)
texreg(tr)

或者直接从模型对象或其摘要中提取值(如果您不想使用texreg的提取函数)，并将指数化的值交给重写参数。

这些解决方案中的任何一个都会产生以下输出(与屏幕显示一起)：

==========================
                Model 1   
--------------------------
(Intercept)      21.00 ***
                 (1.19)   
outcome2          0.63 *  
                 (1.22)   
outcome3          0.75    
                 (1.21)   
treatment2        1.00    
                 (1.22)   
treatment3        1.00    
                 (1.22)   
--------------------------
AIC              56.76    
BIC              57.75    
Log Likelihood  -23.38    
Deviance          5.13    
Num. obs.         9       
==========================
*** p < 0.001, ** p < 0.01, * p < 0.05