如何在hdf5中存储仿真数据？

Question

我想要创建一个存储模拟数据的HDF5文件。数据由一个快照流组成，快照具有相同(或非常相似)的格式，但模拟时间不同。这个想法是，在读取文件时，可以在给定的模拟时间间隔内搜索快照。

如何在HDF5中实现这一点？

很明显，每个快照都必须使用一个H5::Group，它显然必须有不同的名称(例如“快照1”、“snapshot2”等等)。我可以在文件中添加一个snapshot_name:time表进行快速搜索吗？

Answer 1

HDF5是自描述的数据格式，这意味着向每个组添加信息的最佳方法是添加属性。

HDF5 "result.h5" {
GROUP "/" {
   GROUP "Timestep_0" {
      ATTRIBUTE "Time" {
         DATATYPE  H5T_IEEE_F64LE
         DATASPACE  SCALAR
         DATA {
         (0): 0
         }
      }
      DATASET "Temperature" {
         DATATYPE  H5T_IEEE_F32LE
         DATASPACE  SIMPLE { ( 128, 128 ) / ( 128, 128 ) }
         DATA {
         (0,0): ...