受http://gallery.rcpp.org/articles/parallel-distance-matrix/的启发,我尝试使用RcppParallel在高维参数空间中运行蛮力搜索,以便使用多线程进行回溯测试。我陷入了如何在struct部件中调用自定义函数的问题。想法是这样的:
首先,在row中创建参数矩阵NumericMatrix params_mat,并使用带有List, NumericVector, CharacterVector数据类型的反测试数据,比如List Data_1, NumericVector Data_2, CharacterVector Data_3, ...,这些数据对于每个参数场景params_vec都是静态的(注意,这是params_mat行)。
接下来,定义返回测试函数,该函数输出一个向量,该向量包含3个关键变量,用于评估策略性能。
下面是我的params_mat和Backtesting_Fun的一个例子,它们分别可以在R和Rcpp中运行。
//[[Rcpp::export]]
NumericMatrix data_frame_rcpp(const Rcpp::List& list_params)
{
NumericMatrix res = list_params[0];
return res;
}
# R codes to generate params_mat
params <- expand.grid (x_1=seq(1,100,1), x_2=seq(3,100,2), ..., x_n=seq(4,200,1));
list_params = list(ts(params));
tmp_params_data = data_frame_rcpp(list_params);
params_mat = matrix(tmp_params_data, ncol = ncol(tmp_params_data), dimnames = NULL);
params_vec = params_mat[ii,];
# User-defined Rcpp codes for backtesting
NumericVector Backtesting_Fun (List Data_1, NumericVector Data_2, CharacterVector Data_3, ..., NumericVector params_vec)
{
// Main function parts to run backtesting for each params_vec scenario.
... etc
// save 3 key result variables together with each params_vec (just a simple illustration).
NumericVector res = NumericVector::create(params_vec[0],...,params_vec[size-1],
key_1, key_2, key_3);
return res;
}当然,我们需要用RVector类型重写/修改原始的Rcpp Backtesting_Fun,然后使用以下RcppParallel代码在struct Backtest_parallel中调用Backtesting_Fun:
// [[Rcpp::depends(RcppParallel)]]
#include <RcppParallel.h>
using namespace RcppParallel;
RVector<double> Backtesting_Fun (const RVector<double> Data_1, const RVector<double> Data_2,
const RVector<string> Data_3,..., const RVector<double> params_vec)
{
// Main function parts to run backtesting for each params_vec scenario.
... etc;
// save 3 key result variables together with each params_vec
... etc;
return res;
}
struct Backtest_parallel : public Worker
{
// input matrix to read from
const RVector<List> Data_1;
const RVector<double> Data_2;
const RVector<string> Data_3;
...
const RMatrix<double> params_mat;
// output matrix to write to
RMatrix<double> rmat;
// initialize from Rcpp input and output matrixes (the RMatrix class
// can be automatically converted to from the Rcpp matrix type)
Backtest_parallel(const List Data_1, const NumericVector Data_2,
const CharacterVector Data_3, ..., const NumericMatrix params_mat)
: Data_1(Data_1), Data_2(Data_2), Data_3(Data_3), ..., params_mat(params_mat) {}
// function call operator that work for the specified range (begin/end)
void operator()(std::size_t begin, std::size_t end)
{
for (std::size_t ii = begin; ii < end; i++)
{
// params rows that we will operate on
RMatrix<double>::Row params_row = params_mat.row(ii);
// Run the backtesting function defined above
RVector<double> res = Backtesting_Fun(Data_1, Data_2, ..., params_row)
for (std::size_t jj = 0; jj < res.length(); jj++)
{
// write to output matrix
rmat(ii,jj) = res[jj];
}
}
}
};
// [[Rcpp::export]]
NumericMatrix rcpp_parallel_backtest(List Data_1, NumericVector Data_2, CharacterVector Data_3,
..., NumericMatrix params_mat)
{
// allocate the matrix we will return
NumericMatrix rmat(params_mat.nrow(), params_mat.nrow()+3);
// create the worker
Backtest_parallel backtest_parallel(Data_1, Date_2, ..., params_mat);
// call it with parallelFor
parallelFor(0, rmat.nrow(), backtest_parallel);
return rmat;
}以下是我的问题:
RVector是否包含List数据类型,或者RcppParallel中是否存在包含List的特定容器;Backtesting_Fun中,输入应该是RVector/RMatrix类型,这是否意味着我们真的需要将带有NumericVector的原始Rcpp主代码转换为RVector?或者在RcppParallel中有什么更好的方法来实现并行计算呢?提前谢谢。
编辑
struct operator()中的常见思想是使用指针来操作operator()的数据输入,那么在我的例子中,有什么方法可以用指针输入来构建用户定义的函数呢?wrap将RVector/RMatrix转换回Rcpp数据类型,即operator()中的NumericVector..,以便用户定义的函数Backtesting_Fun的输入类型保持不变。发布于 2015-07-07 22:52:16
我想我可能会找到解决这个问题的另一种方法:关键是使用线程安全访问器在struct中包含变量,并将RVector / RMatrix保留在外部主函数中,以便parallelFor能够正常工作,这是并行algo中最重要的部分。以下是我的方法:
List 摆脱了数据类型:相反,我们可以通过使用NumericVector / NumericMatrix容器来转换List变量,并记录其相应的索引,以便子向量/子矩阵将指向与列表元素相同的元素。RVector / RMatrix 转换为 arma::vec / arma::mat:,C++ Armadillo在struct的操作符中是线程安全的。在这里,我使用这个想法修改了基于RcppParallel的并行距离矩阵计算中给出的示例,这个想法几乎保持了相同的测试速度。
结构JsDistance :公共工作者{ const RMatrix tmp_MAT;//输入矩阵从RMatrix tmp_rmat读取;//输出矩阵写入std::size_t row_size,col_size;//将全局输入/输出转换为R-矩阵/R-向量类型JsDistance(const数字矩阵& matrix_input,数字矩阵& matrix_output,std::size_t row_size,std::size_t col_size):tmp_MAT(matrix_input),tmp_rmat(matrix_output),row_size(row_size),col_size(col_size) {} //将Rcpp函数//将RVector转换为arma类型,并在并行计算arma::mat (){ RMatrix tmp_mat =tmp_MAT中共享折叠arma数据;MAT(tmp_mat.begin(),row_size,col_size,false);返回MAT;}col_size运算符(std::size_t begin,std::size_t end) { for (std::size_t i= begin;I< end;i++) { for (std::size_t j= 0;j正如我们所看到的,operator中的数据类型将是C++ arma,现在我们可以安全和快速地调用我们的用户定义的函数,直接使用对象而不是指针,这可能不是泛型的,也不是很容易设计的。
现在,这个parallelFor结构将在并行计算中共享相同的数据源,而不需要额外的副本,然后我们可以使用上述问题中的思想为反测试做一些小小的改变。
https://stackoverflow.com/questions/30791410
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