用R光栅进行交互式绘图:鼠标上方的值

Question

我想在R中做一个小程序，用于交互可视化和修改一些光栅数据集，这些数据集被看作是彩色图像。用户应该打开一个文件(从终端它可以)，绘制它，选择点编辑鼠标点击，并插入新的值。

到目前为止，我很容易做到这一点。我使用来自plot()包的raster函数来可视化绘图，然后通过click()选择点并通过终端编辑它们的值。

我想添加在鼠标上显示值的能力。我已经找到了如何做到这一点的方法，但是标准的R包似乎不可能做到这一点。这是正确的吗？

在这种情况下，我可能被迫使用外部包，如gGobi、iPlots、闪亮包或Plotly包。但是，我非常喜欢接吻，只使用“标准”图形工具，例如光栅plot()函数或网格图形对象(例如来自rasterVis)。

我知道，一个闪亮的应用程序可能是最好的，但它需要大量的时间来学习和完善。

Answer 1

使用leaflet、mapview和leafem，您可以实现如下目标：

library(raster)
library(mapview)
library(leaflet)
library(leafem)

f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)

leaflet() %>% 
  addRasterImage(r, layerId = "values") %>% 
  addMouseCoordinates() %>%
  addImageQuery(r, type="mousemove", layerId = "values")

将其放入闪亮的应用程序中：

library(raster)
library(mapview)
library(leaflet)
library(shiny)

f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)

ui <- fluidPage(
  leafletOutput("map")
)

server <- function(input, output){
  output$map <- renderLeaflet({
    leaflet() %>% 
      addRasterImage(r, layerId = "values") %>% 
      addMouseCoordinates() %>%
      addImageQuery(r, type="mousemove", layerId = "values")
  })
}

shinyApp(ui, server)

下面的示例说明了将光栅转换为简单特性/Shapefile的想法。它不适用于大文件，但标签可以单独设计，数据是可编辑的，可以很容易地显示在一个表中。

library(raster)
library(leaflet)
library(shiny)
library(sf)
library(DT)
library(dplyr)

## DATA
f <- system.file("external/test.grd", package="raster")
r <- raster(f)
r1 = aggregate(r, 30)

sp = st_as_sf(rasterToPolygons(r1))
cn = st_coordinates(st_transform(st_centroid(sp),4326))
sp = st_transform(sp, 4326)
sp = cbind(sp, cn)
sp$id <- 1:nrow(sp)
colnames(sp)[1] <- "value"


## UI
ui <- fluidPage(
  leafletOutput("map"),
  uiOutput("newValueUI"),
  textInput("newVal", label = "Enter new value"),
  actionButton("enter", "Enter new value"),
  hr(),
  dataTableOutput("table")
)


## SERVER
server <- function(input, output){

  ## Reactive Shapefile
  sp_react <- reactiveValues(sp = sp)
  
  ## Leaflet Map
  output$map <- renderLeaflet({
    pal= colorNumeric(topo.colors(25), sp_react$sp$value)
    leaflet() %>% 
      addPolygons(data = sp_react$sp, label= paste(
        "Lng: ", as.character(round(sp_react$sp$X,4)),
        "Lat: ", as.character(round(sp_react$sp$Y,4)),
        "Val: ", as.character(round(sp_react$sp$value,4))),
        color = ~pal(sp_react$sp$value), 
        layerId = sp_react$sp$id
      )
  })
  
  ## Observe Map Clicks
  observeEvent(input$map_shape_click, {
    
    click_id = input$map_shape_click$id
    
    click_grid <- sp_react$sp[sp_react$sp$id == click_id,]

  })
  
  ## Observe Action Button
  observeEvent(input$enter, {
    click_id <- input$map_shape_click$id
    sp_react$sp[sp_react$sp$id == click_id,]$value <- as.numeric(input$newVal)
  })

  ## Data Table
  output$table <- DT::renderDataTable({
    sp_react$sp %>% st_set_geometry(NULL) %>% 
      dplyr::select(id,X,Y,value)
  })
  proxy = dataTableProxy('table')
  
  ## Table Proxy
  observeEvent(input$map_shape_click$id, {
    req(input$map_shape_click$id)
    proxy %>% selectRows(as.numeric(input$map_shape_click$id))
  })
}

shinyApp(ui, server)

Answer 2

我给出了一个简单的例子，说明如何在没有外部Java库的情况下在R中实现它，如果您想要Javan的特性，您可以修改它，但是每个java图形库是不同的，而且我从来没有做过类似的事情。

set.seed(123)
mydata <- data.frame(x = runif(10), y = runif(10))

edit_plot <- function(data) {
  plot(data)

  sel <- locator(n = 1)
  if(is.null(sel)) return(TRUE)
  dd <- (data$x - sel$x)^2 + (data$y - sel$y)^2

  data[which.min(dd),] <- edit(data[which.min(dd),])
  r <- edit_plot(data)
  if(r) return(TRUE)
}
edit_plot(mydata)

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