数字显微图与R之间的数据传输(连接)

Question

我是DM的新用户，我需要在数字显微图像和R之间传输数据(像素亮)，以处理和建模图像。

具体来说，我需要从原始图像中提取亮像素，将其发送到R进行处理，然后返回DM以表示新图像。

我想知道这是否可能，以及如何在DM脚本中实现。

非常感谢。致以问候。

Answer 1

DM (脚本)和外部世界之间几乎没有直接联系，所以最好的解决方案很可能是以下(以DM为中心的)路由：

在DM中启动了一个脚本，它可以：

• 所需的所有UI
• 提取强度等。
• 将所有必需的数据以适当的格式保存在特定路径上的光盘上。(原始数据/文本-数据/.)
• 调用外部应用程序(可以从命令提示符调用的任何内容，包括.bat文件)，并等待该命令完成

您的所有R代码都是以可以从命令提示符调用的方式编写的，可能具有命令提示符参数(即配置文件)：

• 从特定路径读取数据
• 按需要处理(没有UI，所以请“静默地”处理)
• 将结果保存在特定路径上的磁盘上
• 封闭应用

此时，DM中的脚本仍在继续，读取结果(并可能对磁盘上的文件进行清理)。

因此，在本质上，重要的是你的R代码可以作为一个“独立的”黑匣子执行完全由命令行参数控制。

启动外部应用程序所需的命令可以在“实用程序函数”下的帮助文档中找到，它是LaunchExternalProcess。它是在GMS 2.3.1中引入的。

Answer 2

您可能还想尝试使用命令ScrapCopy()和ScrapPasteNew()将图像(或图像分区)复制到剪贴板中，但我不确定那里的数据是如何处理的。