假设我适合这样的模特:
ctree(Age ~ Kyphosis, data = kyphosis, mincriterion = 1)我怎么能得到分裂的数目?我怎么知道它是否只是一个根节点?
编辑:
使用的包:
library(caret)
library(party)
library(partykit)
library(plyr)
library(xtable)当我尝试使用tree.size时出错,如下所示:
> tree.size(ctree(Age ~ Kyphosis, data = kyphosis, mincriterion = 1)@tree)
Error in tree.size(ctree(Age ~ Kyphosis, data = kyphosis, mincriterion = 1)@tree) :
trying to get slot "tree" from an object (class "constparty") that is not an S4 object 发布于 2015-03-30 02:07:45
从各方包文档来看,拟合模型中的tree槽是树的递归表示。您可以构建自己的递归函数来确定树的大小:
tree.size <- function(tree) {
if (is.null(tree)) {
return(0)
} else {
return(1 + tree.size(tree$left) + tree.size(tree$right))
}
}我们可以使用只包含根节点的树和具有多个节点的树来测试函数:
library(rpart) # for kyphosis
library(party) # for ctree
mod1 <- ctree(Age ~ Kyphosis, data = kyphosis)
tree.size(mod1@tree)
# [1] 1
mod2 <- ctree(Petal.Width~., data=iris)
tree.size(mod2@tree)
# [1] 11更新:基于更新的问题,OP实际上使用的是partykit:::ctree函数而不是party:::ctree函数。事实证明,获得树的大小要容易得多,因为返回的模型是节点的列表,所以所需的只是length函数。
library(partykit)
mod1 <- partykit:::ctree(Age ~ Kyphosis, data = kyphosis)
length(mod1)
# [1] 1
mod2 <- partykit:::ctree(Petal.Width~., data=iris)
length(mod2)
# [1] 11发布于 2015-03-30 13:27:48
这个问题的其他答案/讨论没有什么问题,我只是想增加一些细节/上下文,以防其他用户遇到相同或类似的问题。
虽然在旧的ctree()包和新的partykit包中的许多方面保持不变,以便简化转换,但几乎所有的R和C代码都被重写和简化,内部表示完全是新的。旧的ctree()返回了一个S4对象,它不够灵活,不能满足我们想要做的所有事情。新的ctree()函数返回继承于一般"party"类的类"constparty"对象(用于递归分区,每个节点中具有常量fit )。
节点数可以用length()方法查询,终端节点数可以用width()方法查询。节点数也在print()方法中报告。最后,可以通过nodeids()查询节点ID。对于只有根节点的树:
data("kyphosis", package = "rpart")
library("partykit")
ct1 <- ctree(Age ~ ., data = kyphosis)
length(ct1)
[1] 1
width(ct1)
[1] 1一棵更大的树:
(ct2 <- ctree(Number ~ ., data = kyphosis))
Model formula:
Number ~ Kyphosis + Age + Start
Fitted party:
[1] root
| [2] Start <= 15: 4.475 (n = 59, err = 152.7)
| [3] Start > 15: 2.909 (n = 22, err = 17.8)
Number of inner nodes: 1
Number of terminal nodes: 2
length(ct2)
[1] 3
width(ct2)
[1] 2
nodeids(ct2)
[1] 1 2 3
nodeids(ct2, terminal = TRUE)
[1] 2 3一揽子小插曲还提供了许多其他有用的细节。vignette("partykit", package = "partykit")对包及其类做了一般性介绍;vignette("constparty", package = "partykit")用常量拟合描述树类;vignette("ctree", package = "partykit")提供了关于ctree()的其他详细信息。
https://stackoverflow.com/questions/29337193
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