我有一个长行的文件,其中包含许多列,每列都有标题,如下所示。
BMR_22@O15-BMR_1@O23-H23 BMR_14@O22-BMR_1@O26-H26 BMR_14@O14-BMR_1@O26-H26 BMR_14@O12-BMR_1@O16-H16 BMR_17@O26-BMR_2@O24-H24 BMS_88@O22-BMR_4@O22-H22 BMS_89@O22-BMR_4@O26-H26 BMS_89@O12-BMR_4@O12-H12 BMR_15@O25-BMR_15@O26-H26 BMS_96@O25-BMR_5@O16-H16 BMR_13@O23-BMR_6@O26-H26 BMR_27@O22-BMR_126@O12-H12 BMR_17@O26-BMR_6@O13-H13 BMR_26@O26-BMR_6@O16-H16 BMR_29@O26-BMR_7@O16-H16 BMS_86@O23-BMR_19@O26-H26 BMS_78@O16-BMR_9@O16-H16 BMS_96@O24-BMR_10@O23-H23 BMR_14@O25-BMR_11@O24-H24 BMS_90@O22-BMR_11@O26-H26 BMR_25@O13-BMR_11@O12-H12 BMR_120@O24-BMR_11@O13-H13 BMR_25@O22-BMR_11@O13-H13 BMS_65@O24-BMR_12@O23-H23 BMR_31@O11-BMR_12@O12-H12我想根据一些标准选择列。如果使用下面的命令:
awk 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9]@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile我得到的东西是:
BMR_1@O13-BMR_14@O13-H13
BMR_2@O13-BMR_16@O13-H13
BMR_6@O13-BMR_27@O23-H23
BMR_2@O13-BMR_16@O12-H12
BMR_1@O13-BMR_30@O26-H26
BMR_1@O13-BMR_11@O23-H23
BMR_1@O13-BMR_14@O22-H22
BMR_6@O13-BMR_27@O22-H22如果我使用以下命令:
awk 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9][1-9]@O13-BMR/) print $i } ' inPutFile我得到的输出如下:
BMR_25@O13-BMR_11@O12-H12
BMR_26@O13-BMR_25@O12-H12
BMR_17@O13-BMR_27@O13-H13
BMR_64@O13-BMR_39@O12-H12
BMR_58@O13-BMR_44@O16-H16
BMR_36@O13-BMR_61@O12-H12
BMR_36@O13-BMR_61@O13-H13如果我想同时选择单数和两位数(比如BMR_2@O13-BMR_16@O12-H12和BMR_26@O13-BMR_25@O12-H12) ),那么命令可以是什么呢?
发布于 2015-03-17 05:47:14
您可以在单个awk命令中将重复指定为1或2,如下所示:
awk --posix 'NR==1{for (i=1;i<=NF;i++) if ($i~/^BMR_[1-9]{1,2}@O13-BMR/) print $i } ' inPutFilehttps://stackoverflow.com/questions/29091992
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