所有组合的graph.lattice ( R)

Question

问候:这个图表应该是非常简单的东西，使用igraph为R。我正在试图找出我需要传递的参数，以获得子模式和超级模式之间的边。在本例中，表示由5个项组成的项集。

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我确信这一点通过graph.lattice函数在igraph中得到了解决，但我还没有计算出要传递的参数。请注意，提供的图表来自数据挖掘:概念和技术(Han，Kamber，& Pei，2011)。

提前感谢您的指导。

Answer 1

我不认为graph.lattice能够创建这样的图形。但是您可以定义一个新函数：

graph.comb <- function(word) {
  # creates graph objects from character combination in word
  # example graph.comb("abc")

  do_layer <- function(words) {
    do.call( rbind, lapply(words, function(word){
      l_vec <- sapply(seq_len(nchar(word)), function(l) substring(word, l, l))
      w_comb <- apply(combn(l_vec, nchar(word)-1), 2, paste, collapse = "")
      w_df <- expand.grid(from = w_comb, to = word, stringsAsFactors = FALSE)
    }))
  }

  df_edges <- data.frame(from = word, to = NA, stringsAsFactors = FALSE)
  df2 <- df_edges
  while( min(nchar(df_edges$from)) > 0) {
    df2 <- do_layer(df2$from)
    df_edges <- rbind(df_edges, df2)
  }
  df_edges <- df_edges[complete.cases(df_edges), ]
  df_edges <- df_edges[!duplicated(df_edges), ]
  return(graph.data.frame(df_edges ))
}

将它与任何字符串一起使用：

g1 <- graph.comb("abcd")
plot(g1, layout = layout.sugiyama(g1)$layout )

结果：

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