使用package hdf5storage向hdf5storage文件中添加一个新变量

Question

是否可以使用package hdf5storage向一个hdf5storage文件(v7.3)添加一个新变量

示例：

我在Matlab中写道：

test = {'Hello', 'world!'; 'Good', 'morning'; 'See', 'you!'};
save('data.mat', 'test', '-v7.3') % v7.3 so that it is readable by h5py

​

​

在Python中，我想向data.mat添加一个新变量。我怎样才能做到这一点，例如：

​

​

我试过：

import hdf5storage # get code on https://pypi.python.org/pypi/hdf5storage/0.1.3
import numpy as np

matcontent = {}
matcontent[u'some_numbers'] = np.array([10, 50, 20]) # each key must be a unicode string
hdf5storage.write(matcontent, '.', 'data.mat', matlab_compatible=True)

但是它覆盖了data.mat，而不是添加一个新变量。

Answer 1

您正在创建新数据，然后将该新数据写入文件。它覆盖了文件。您需要加载原始.mat文件，并将其附加到其中，然后再次保存。

import hdf5storage
import numpy as np

matcontent = hdf5storage.loadmat('data.mat')
matcontent[u'some_numbers'] = np.array([10, 50, 20])
hdf5storage.savemat('data.mat', matcontent)

然后在Matlab中

>> whos -file data.mat
      Name              Size            Bytes  Class    Attributes

      some_numbers      1x3                24  int64              
      test              3x2               730  cell   

Answer 2

到目前为止我知道这是不可能的。TheBlackCat提供的答案并不适用，因为您正在重写您的文件。我倾向于有很大的matlab文件，我通常不想完全阅读，而是有选择地读或写。这是在HDF5文件中使用的底层.mat格式的最大优势(连同引用)。Python包hdf5storage仍然在0.xx版本中，因此我认为这将在以后的版本中出现。