在集群上安装rstan时,应该如何选择用于构建的核心数量(在Sys.setenv(MAKEFLAGS = "-j4"中描述的行文档中)?如果集群中的每个节点都有16个核心,那么将值设置为16是否合理?如果用户希望使用MPI跨多个节点运行stan,怎么办?或者,在任何情况下,将价值保持在4是最有意义的,因为大多数人将不超过4条链并行运行?我真的很感谢你对这个环境的任何建议。
发布于 2015-01-19 03:45:21
为了完整起见,我回答了约翰的问题时,他把它张贴在斯坦用户的邮件列表。简而言之,在构建时使用多少个核并不重要,您可以在运行时使用由R支持的任何并行方案(或Stan的任何其他接口)。
https://stackoverflow.com/questions/28012469
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