将变量传递给R中的WinBugs模型

Question

我正在使用R2WinBugs包。我想将前面在R脚本中计算的两个参数传递给模型函数

c0yy <- 0.1
syy <- 0.0001
#Model
model <- function(c0yy,syy){

  #Likelihood
  for(i in 1:n){
    y[i] ~ dnorm(mu[i],cyy)
  }

  #Regression formula
  for(i in 1:n){
    mu[i] <- alpha + gamma * x[i]
  }

  #Priors for the regression parameters
  alpha ~ dnorm(0,0.000001)
  gamma ~ dnorm(0,0.000001)

  #Priors for the precision parameter
  cyy ~ dnorm(c0yy,syy)

  #Monitored variables
  beta <- gamma/(alpha-1)  
}
filename <- file.path(tempdir(), "Olm.txt")
write.model(model, filename)

但我知道这个错误

made use of undefined node c0yy

当我在模型函数中用c0yy和syy替换值时，它是有效的。有什么帮助吗？

谢谢

Answer 1

要传递到模型的值是数据。在BUGS (和R2WinBUGS)中，数据作为独立的实体传递给程序，而不是您定义的模型。为了包括数据，你可以把它们放到一个列表中，比如；

my.mcmc <- bugs(data = list(c0yy = 0.1, syy= 0.0001), params = "beta', model.file = "Olm.txt", n.iter=10000) 

您还需要从模型脚本中删除<- function(c0yy,syy)。