ImageJ:在计算面积%时使用ROI分析粒子

Question

我是一个使用ImageJ的初学者。我有一个4“直径的硅片的图像，我第一次缩放这个图像。然后我做了一个阈值颜色，只突出空洞。然后我在晶片周围放一个ROI。

然后我运行分析粒子例程，它很好地包围了空隙，在汇总表中，总区域列似乎是正确的#对于总空白区。但是%Area列#是低的，我认为是因为它使用的是总量区域\整个图像区域。我想告诉我晶片中排尿的百分比，那就是总空隙面积\ROI区域(晶圆区)。有什么简单的方法吗，还是我做错了什么？另一个选择是，我计划把这个记录在宏中，因为我知道总晶片面积，我假设我可以做一些数学，把总空白面积除以已知的晶圆面积，得到我正在寻找的通过宏输出的晶片%排空数，但是在如何做到这一点方面需要一些帮助。如果能对此提供任何帮助，我们将不胜感激。谢谢，史蒂夫

Answer 1

您可以在“分析”>“http://imagej.nih.gov/ij/docs/guide/146-30.html#sub:Set-Measurements...”中使用“阈值限制”选项来度量ROI的全部区域(如果未选中该选项)，并且只测量ROI中的阈值区域(如果选中该选项)。然后，您可以按照您的建议，将百分比计算为两个度量的比率。

当你运行插件>宏>记录.在执行这些步骤之前，宏记录器将列出执行分析所需的命令，例如：

setAutoThreshold("Default");
run("Set Measurements...", "area limit redirect=None decimal=3");
run("Measure");
run("Set Measurements...", "area redirect=None decimal=3");
run("Measure");

然后使用宏函数获取所需的结果并计算您的比率，或者将结果窗口保存为Excel文件，并在不同的应用程序中进行计算。