学习pairwise_distances是不精确的吗？

Question

pairwise_distances提供了与数组X的距离矩阵，但是对于某些输入，结果似乎并不精确。

示例：

from sklearn.metrics.pairwise import pairwise_distances
X = [[-0.903858372568, -0.5521578], [-0.903858372568, -0.55215782]]
print pairwise_distances(X)

给出以下输出：

[[ 0.  0.]
[ 0.  0.]]

虽然距离是0.00000002。

第二个例子：

X = [[-0.903858372568, -0.5521578], [-0.903858372568, -0.552157821]]

给出

[[  0.00000000e+00   2.10734243e-08]
[  2.10734243e-08   0.00000000e+00]]

这里有一个距离，但只有第一个数字是正确的。

对于我的应用程序来说，如果输出可以是零，尽管有一段距离，这是不可取的。有什么提高精度的好方法吗？

Answer 1

我没有探究为什么科学知识给出如此不精确的结果，但它似乎更准确。试试这个：

from scipy.spatial.distance import pdist, squareform
squareform(pdist(X))

例如,

X = [[-0.903858372568, -0.5521578], [-0.903858372568, -0.552157821]]

给出

array([[  0.00000000e+00,   2.10000000e-08],
       [  2.10000000e-08,   0.00000000e+00]])