使用stri_count_fixed并返回不正确的参数数错误的overlap=TRUE

Question

今天，我看到了一篇新的文章，内容涉及到一个新的"overlap=TRUE"包添加，您可以在其中将参数添加到一些stringi搜索函数中。

这是帖子。

然而，我已经尝试了bartektartanus建议的确切代码(从安装到示例)，在运行它时，我得到了错误的参数数(3)，期望2表示'stri_count_fixed'

> library("stringi", lib.loc="D:/Program Files/RRO/R-3.1.1/library")
> DNAlst<-list("CAAACTGATTTT","GATGAAAGTAAAATACCG","ATTATGC","TGGA","CGCGCATCAA")
> dna <- stri_paste(rep(c("A","C","G","T"),each=4),c("A","C","G","T"))
> result <- t(sapply(DNAlst, stri_count_fixed,pattern=dna,overlap=TRUE))
Error in .Call("stri_count_fixed", str, pattern, overlap, PACKAGE = "stringi") : 
  Incorrect number of arguments (3), expecting 2 for 'stri_count_fixed'
> colnames(result) <- dna
Error in colnames(result) <- dna : object 'result' not found

我想知道这是因为这是新事物，还是我做错了什么。

Devtools版本: 1.6

Stringi版本: 0.3-1

R版本= 3.1.1 (RRO 8.0 beta版)

运行在Windows8.1上的64位

Answer 1

这个问题之所以发生，是因为R试图找到Rtools，但它找不到，系统的快捷方式是错误的。您需要Rtools才能正确地执行devtools。可悲的是，当我做一些与Rtools和devtools lol完全无关的事情时，我意识到了这一点。

> library("devtools", lib.loc="D:/Program Files/RRO/R-3.1.1/library")
WARNING: Rtools is required to build R packages, but the version of Rtools previously
installed in F:/Program Files/Rtools has been deleted.

在从这个cran链接重新安装了Rtools之后，这个程序按原来的方式工作了.

然而，安装这个版本的stringi花费了将近半个小时的时间。

Answer 2

你可能安装错了。这种重叠有单独的分支。新的弦I0.3版本即将发布，重叠还没有包括在内:)但是，当我们正确测试它时，它将与0.4版本一起发布。所以现在，从这个分支安装它：fixed_overlap

library('devtools') # call install.packages('devtools') first
install_github('Rexamine/stringi', ref = "fixed_overlap")