在R中安装cnv-seq.tar.gz

Question

我正试图在我的R库中安装这个cnv软件包，以帮助复制数字变化分析。但是，当我输入

install.packages("cnv-seq")

在R命令中，会弹出一个错误代码，表示3.1.1版本不可用。所以我也尝试了旧的版本。所有人都说没有。我重复检查菜单，软件包->安装软件包->。无cnv-seq

好的。然后我尝试从一个本地源，即"cnv-seq.tar.gz“安装它。

当我打字时

install.packages("C:/cnv-seq.tar.gz", repos=NULL, type="source")

它仍然返回一个错误，该错误表示无法从此文件提取包。软件包的安装具有非零退出状态。

什么地方出了问题，或者还有其他的我可以手动安装这个包到我的电脑上吗？几年前看过一个类似的问题之后，

如何从源安装R包？

我还是解决不了这个问题。

Answer 1

这是RTFM的一个例子;)

您可以在下面的R中完成整个过程，我们将归档文件下载到临时目录，然后解压缩，最后安装。

download.file('http://tiger.dbs.nus.edu.sg/cnv-seq/cnv-seq.tar.gz', 
              f <- tempfile())
untar(f, exdir=tempdir())
install.packages(file.path(tempdir(), 'cnv-seq', 'cnv'), type='source', repos=NULL)

Answer 2

我相信你必须先打开文件。如果您没有访问linux机器的权限，我相信7zip具有此功能。linux命令将是：

tar -xvf  /path/to/file/cnv-seq.tar.gz 

这样做之后，您应该能够将包导入到R中。