自动化RStudio处理的RMarkdown？

Question

我有一个RMarkdown文件，用来生成一个很好的HTML。问题是，我想让它自动化，这样它就可以在无头服务器上运行。因此，没有人可以启动Rstudio并按下'knithtml‘按钮，而且Rstudio似乎正在执行许多额外的魔术，比如拥有自己版本的pandoc、运行所有必要的命令、应用css样式等等。

当我按下'knithtml‘按钮，但只运行一个R脚本时，我如何获得这个报告并生成Rstudio生成的相同的东西呢？

谢谢。

Answer 1

试着使用

rmarkdown::render("/PATH/TO/YOUR.Rmd", output_file="/PATH/TO/YOUR/OUTPUT.html")

而不是。这假设您已经将rmarkdown库加载到您的无头盒中。它将使用系统pandoc，但确保它是1.12或更高。

下面是knit2html所做的工作(通过“Console”附近的"R“选项卡)：

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这是一个并排的。左边是单击按钮，右边是运行命令：

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Answer 2

我也有过同样的问题。在经历了大量蛮力之后，我得到了与RStudio相同的结果，命令行如下：

"path\to\Rscript.exe" -e "rmarkdown::find_pandoc(dir='path/to/RStudio/bin/pandoc'); rmarkdown::render('file.Rmd')"