在运行RStudio的后台码头中使用ENV变量

Question

我能够设置一个带有默认ENV变量的Dockerfile，然后在运行我的码头容器时可以配置这些变量，例如，在Dockerfile中，我有以下行：

ENV USERNAME ropensci
ENV EMAIL ropensci@github.com
RUN git config --global user.name $USERNAME
RUN git config --global user.email $EMAIL

太棒了。当我启动互动会议时：

docker run -it --env USERNAME="Carl" --env EMAIL=cboettig@example.com myimage /bin/bash

然后，我可以发出命令git config --list，并看到git被配置为使用我在命令行中提供的值，而不是缺省值。

但是，我的Dockerfile也被配置为运行一个RStudio服务器，然后当我以Daemon模式运行映像时，可以登录到浏览器中：

docker run -d -p 8787:8787 --env USERNAME="Carl" --env EMAIL=cboettig@example.com cboettig/ropensci-docker

我转到localhost:8787并登录到RStudio，所有这些都能正常工作，启动一个启用git的新“项目”，但是RStudio却找不到我的git名称和电子邮件。我可以从RStudio菜单中打开shell，运行git config --list或echo $USERNAME，然后只得到一个空白值。为什么这对/bin/bash有效，而不适用于RStudio，以及如何修复它？

Answer 1

您的git配置设置在/.gitconfig上。此配置文件是为根用户提供的。您需要为rstudio用户设置git配置，因为rstudio运行在rstudio用户上。下面的命令是一个临时解决方案。

docker run -it -p 8787:8787 --env USERNAME="Carl" --env EMAIL=cboettig@example.com cboettig/ropensci-docker bash -c "cp /.gitconfig /home/rstudio; /usr/bin/supervisord"

它起作用了!

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另一种解决方案是基于cboettig/ropensci-docker编写Dockerfile。下面是示例Dockerfile。

FROM cboettig/ropensci-docker
RUN cp /.gitconfig /home/rstudio
CMD ["/usr/bin/supervisord"]