如何使用HDF5Store读取/写入子组？

Question

在进行分析之前，我使用HDF5Store存储一些处理过的结果。我想在商店里放三种结果，

• 未处理的原始结果，只需读取并与原来的CSV格式合并即可。
• 从原始结果派生出来的经过处理的结果，这些结果有一些处理和划分为更逻辑的分组。
• 摘要的结果，有有用的总结列添加和删除冗余列，以便于阅读。

我认为一个具有等级密钥的HDF5Store可以做到这一点，一个用于原始数据，一个用于处理，另一个用于汇总。

我想要一个这样的结构：

<class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: results.h5
/proccessed/dbn_reinit                           frame        (shape->[22880,19])
/proccessed/dbn_rerep_code                       frame        (shape->[11440,18])
/proccessed/dbn_rerep_enhanced_input             frame        (shape->[11440,18])
/proccessed/linear_classifier                    frame        (shape->[572,18])  
/proccessed/msda_rerep_code                      frame        (shape->[18304,17])
/proccessed/msda_rerep_enhanced_input            frame        (shape->[18304,17])
/raw/dbn_reinit                                  frame        (shape->[22880,15])
/raw/dbn_rerep                                   frame        (shape->[23452,15])
/raw/msda_rerep                                  frame        (shape->[36608,14])
/summerised/dbn_reinit                           frame        (shape->[22880,10])
/summerised/dbn_rerep_code                       frame        (shape->[11440,9]) 
/summerised/dbn_rerep_enhanced_input             frame        (shape->[11440,9]) 
/summerised/linear_classifier                    frame        (shape->[572,6])   
/summerised/msda_rerep_code                      frame        (shape->[18304,10])
/summerised/msda_rerep_enhanced_input            frame        (shape->[18304,10])

我本以为我可以通过说：

store = pandas.HDF5Store('results.h5')
store.add_group('raw')
raw_store = store['raw'] 
raw_store['dbn_reinit'] = dbn_reinit_dataframe
raw_store['dbn_rerep_code'] = dbn_rerep_code_dataframe
...

等

然而，似乎并没有一种方法来获得一个商店的一个分组，并使用它，因为它是一个商店，

所以我不得不：

store = pd.HDFStore('results.h5', mode='w')

store['raw/dbn_reinit'] = dbn_reinit_dataframe
store['raw/dbn_rerep'] = dbn_reinit_dataframe
...

这是冗长的，并没有真正显示出任何一种分组的结果到三个猫，我是不是遗漏了什么？或者是HDF的分层特性，仅仅是写包含/的长键名称呢？

Answer 1

使用层次键的文档是这里。.remove()具有这种类型的功能，您可以在该级别并在树下删除节点。

您可以这样做：store.get_storer('foo')返回包含对节点的访问的对象。(如.group)。但是，这个对象不允许您添加/选择子节点，也不允许它提供该节点的良好响应。

您可以在github上输入这些特性的功能请求。请包括一个可复制的例子，你认为这应该做什么。

拉-请求是欢迎！

我很少使用多个组。主要是因为使用不同文件的灵活性。你可以做你想做的事情，我只是从来没有发现它的必要性(例如，把你的组当作文件本身)。HDF5不是一个数据库，所以这很少有用。