如何在python中使用takeWhile

Question

我没有得到正确的答案，但我不知道我的问题在哪里

def GC_content(genetic_string):
    """
    :param genetic_string:
    :return: GC content in percentage
    :testmod

    >>> GC_content("CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGACTGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT")
    60.919540
    """
    counter = 0.0
    for index in takewhile(lambda x: x is "C" or x is "G", list(genetic_string)):
        counter += 1.0

    return  counter/float(len(genetic_string))

Answer 1

你似乎在寻找：

s = list(genetic_string)
return (s.count('G') + s.count('C')) / float(len(s)) * 100

只要给定的条件保持不变，takewhile只接受可迭代(字符串)开头的字符，但您希望查看整个字符串。换句话说，如果您希望得到60.919540的结果，那么takewhile就不太合适了。

Answer 2

因为它只返回上的所有匹配，直到第一个不匹配的才有效。

In [8]: gc = 'CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGACTGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT'

In [9]: list(takewhile(lambda x: x is "C" or x is "G", gc))
Out[9]: ['C', 'C']

Answer 3

您的代码必须如下所示才能根据需要工作：

from itertools import takewhile

def GC_content(genetic_string):
    """
    :param genetic_string:
    :return: GC content in percentage
    :testmod

    >>> GC_content("CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGACTGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT")
    60.919540
    """
    counter = 0.0

    for c in list(genetic_string):
        if(c == 'C' or c=='G'):
            counter += 1.0

    return  counter/float(len(genetic_string)) * 100


result = GC_content("CCACCCTCGTGGTATGGCTAGGCATTCAGGAACCGGAGAACGCTTCAGACCAGCCCGGACTGGGAACCTGCGGGCAGTAGGTGGAAT")
print(result)    # 60.91954022988506

获取返回元素，直到谓词第一次返回"FALSE“(即计数器只增加两倍-对于第一个"CC”字母)。要理解代码中有相同的部分，其逻辑与使用“接受时”相同。

for c in list(genetic_string):
    if(c == 'C' or c=='G'):
        counter += 1.0
    else:
        break

此外，您也忘记将结果乘以100，" is“运算符不用于比较值-它比较值的类型(例如检查”整数不是字符串“)。