链接用于pyFFTW安装的fftw库时出错

Question

我试图将pyFFTW 0.9.2安装到OSX中，但遇到了以下错误：

/usr/bin/clang -bundle -undefined dynamic_lookup
-L//anaconda/lib -arch x86_64 -arch x86_64 
build/temp.macosx-10.5-x86_64-2.7/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pyFFTW-master/pyfftw/pyfftw.o 
-L//anaconda/lib -lfftw3 -lfftw3f -lfftw3l -lfftw3_threads -lfftw3f_threads -lfftw3l_threads 
-o build/lib.macosx-10.5-x86_64-2.7/pyfftw/pyfftw.so

ld: library not found for -lfftw3

clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

正如在线程中提到的，我曾三次编译和安装FFTW3.3.4。但这对我不起作用。

我所做的是：

./configure --enable-float --enable-share  => make => make install
./configure --enable-long-double --enable-share  => make => make install
./configure --enable-threads --enable-share  => make => make install

然后在pyFFTW文件夹中运行python (2.7)安装文件，并得到上面的错误。

谢谢你的帮助。

Answer 1

我在OSX 10.9.4 Maverick上也有过同样的问题。尝试如下:下载FFTW3.3.4，然后打开一个终端窗口，进入解压的FFTW目录并运行以下命令：

$ ./configure --enable-long-double --enable-threads
$ make
$ sudo make install
$ ./configure --enable-float --enable-threads
$ make
$ sudo make install

而不是按建议使用pip安装pyFFTW：

$ sudo pip install pyfftw

Answer 2

我使用的是通过MacOX安装的conda 10.11.4和Python3.5.1，上面的答案对我无效。

我仍然会得到这个错误：

ld: library not found for -lfftw3l
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
error: command 'gcc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Failed building wheel for pyfftw

或者：

ld: library not found for -lfftw3l_threads
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
error: command 'gcc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Failed building wheel for pyfftw

对我起作用的是我发现的这里的细微变化

先安装长双库

comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-long-double CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install

然后安装浮动库和双库。

comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-sse2 --enable-float CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install
comp:fftw-3.3.4 user$ ./configure --enable-threads --enable-shared --disable-fortran --enable-sse2 CFLAGS="-O3 -fno-common -fomit-frame-pointer -fstrict-aliasing"
comp:fftw-3.3.4 user$ make
comp:fftw-3.3.4 user$ sudo make install

然后安装pyfftw

comp:fftw-3.3.4 user$ sudo -H  pip install pyfftw

我不认为--disable-fortran和--enable-sse2标志是必要的，我也不确定sudo对于pip是否必要，但这才是对我有用的。

注意，当您完成时，/usr/local/lib文件夹应该包含以下文件：

libfftw3.3.dylib
libfftw3.a
libfftw3.dylib
libfftw3.la
libfftw3_threads.3.dylib
libfftw3_threads.a
libfftw3_threads.dylib
libfftw3_threads.la
libfftw3f.3.dylib
libfftw3f.a
libfftw3f.dylib
libfftw3f.la
libfftw3f_threads.3.dylib
libfftw3f_threads.a
libfftw3f_threads.dylib
libfftw3f_threads.la
libfftw3l.3.dylib
libfftw3l.a
libfftw3l.dylib
libfftw3l.la
libfftw3l_threads.3.dylib
libfftw3l_threads.a
libfftw3l_threads.dylib
libfftw3l_threads.la