混合模型中运行汇总()后的Colname错误

Question

R version 3.1.0 (2014-04-10)
lmer package version 1.1-6
lmerTest package version 2.0-6

我目前正在与lmer和lmerTest合作进行我的分析。每次向随机结构添加效果时，运行汇总()时都会出现以下错误：

#Fitting a mixed model: 
TRT5ToVerb.lmer3 = lmer(TRT5ToVerb ~ Group + Condition + (1+Condition|Participant) + (1|Trial), data=AllData, REML=FALSE, na.action=na.omit)
summary(TRT5ToVerb.lmer3)
 Error in `colnames<-`(`*tmp*`, value = c("Estimate", "Std. Error", "df",  : length of 'dimnames' [2] not equal to array extent

如果我这样离开这个结构：

TRT5ToVerb.lmer2 = lmer(TRT5ToVerb ~ Group + Condition + (1|Participant) + (1|Trial),  data=AllData, REML=FALSE, na.action=na.omit)

没有误差运行总结(TRT5ToVerb.lmer2)、返回AIC、BIC、logLik偏差、随机效应估计、固定效应估计及其对应p-值等。

因此，显然在我运行lmerTest时发生了一些事情，尽管存在对象TRT5ToVerb.lmer3。这两种结构之间唯一的区别是随机结构：(1+Condition|Participant)和(1\x参与者)

我的数据的一些特点：

1. 条件和组都是分类变量:条件包括三个层次，第二组
2. 因变量(TRT5ToVerb)是连续的:它对应于以ms表示的读取时间。
3. 这是一个重复的测量实验，每个参与者有48个观察(participants=28)

我读过this threat，但找不到清晰的解决方案。难道我必须把我的数据转换成长格式吗？如果是这样的话，那我该如何处理这个问题呢？我希望不是这样。

谢谢!

免责声明:我既不是R方面的专家，也不是统计学方面的专家，所以请耐心点。

Answer 1

(应该是注释，但是太长/代码格式等)

这个假示例似乎适用于lmerTest 2.0-6和lme4的开发版本(1.1-8；但我不认为这个示例与1.1-6有任何相关的区别.)

AllData <- expand.grid(Condition=factor(1:3),Group=factor(1:2),
                  Participant=1:28,Trial=1:8)
form <- TRT5ToVerb ~ Group + Condition + (1+Condition|Participant) + (1|Trial)
library(lme4)
set.seed(101)
AllData$TRT5ToVerb <- simulate(form[-2],
               newdata=AllData,
               family=gaussian,
               newparam=list(theta=rep(1,7),sigma=1,beta=rep(0,4)))[[1]]
library(lmerTest)
lmer3 <- lmer(form,data=AllData,REML=FALSE)
summary(lmer3)

生产：

Linear mixed model fit by maximum likelihood  ['merModLmerTest']
Formula: TRT5ToVerb ~ Group + Condition + (1 + Condition | Participant) +  
    (1 | Trial)
   Data: AllData

     AIC      BIC   logLik deviance df.resid 
  4073.6   4136.0  -2024.8   4049.6     1332 

Scaled residuals: 
     Min       1Q   Median       3Q      Max 
-2.97773 -0.65923  0.02319  0.66454  2.98854 

Random effects:
 Groups      Name        Variance Std.Dev. Corr     
 Participant (Intercept) 0.8546   0.9245            
             Condition2  1.3596   1.1660   0.58     
             Condition3  3.3558   1.8319   0.44 0.82
 Trial       (Intercept) 0.9978   0.9989            
 Residual                0.9662   0.9829            
Number of obs: 1344, groups:  Participant, 28; Trial, 8

Fixed effects:
              Estimate Std. Error         df t value Pr(>|t|)
(Intercept)    0.49867    0.39764   12.40000   1.254    0.233
Group2         0.03002    0.05362 1252.90000   0.560    0.576
Condition2    -0.03777    0.22994   28.00000  -0.164    0.871
Condition3    -0.27796    0.35237   28.00000  -0.789    0.437

Correlation of Fixed Effects:
           (Intr) Group2 Cndtn2
Group2     -0.067              
Condition2  0.220  0.000       
Condition3  0.172  0.000  0.794