用SimpleITK 3的CMake构建CMake

Question

我想从源代码构建SimpleITK，并为Python3.4安装它(在Ubuntu14.04上)。

我跟踪了SimpleITK构建指令。

git clone http://itk.org/SimpleITK.git
mkdir SimpleITK-build
cd SimpleITK-build
cmake ../SimpleITK/SuperBuild

而且效果很好。我能够使用SimpleITK为Python2.7安装sudo python setup.py install。然后，我尝试使用sudo python3.4 setup.py install为Python3.4安装它，尽管它的安装似乎是正确的，但是当我试图在Python3中导入SimpleITK时，我得到了：

...    
    File "/usr/lib/python3.4/imp.py", line 243, in load_module
        return load_dynamic(name, filename, file)
ImportError: dynamic module does not define init function (PyInit__SimpleITK)

在上面的构建说明中，它说：

验证和/或将高级cmake变量更正为特定于语言的可执行文件、库和包含目录。例如，如果有多个Python安装，请确保所有相关的Python变量都引用相同的版本。

我没有这样做，我怀疑这就是为什么它只适用于Python2.7。如何纠正“高级cmake变量”？

Answer 1

下面是我在Linux上使用的所有步骤(构建耀因的答案和官方文件)。

获取SimpleITK源代码

cd ~
git clone --recursive http://itk.org/SimpleITK.git

设置最新稳定版本

cd ~/SimpleITK
git tag

查找最新的稳定版本(对我来说是"v0.8.0")，然后通过

git checkout v0.8.0

别担心关于“超然”的警告。

构建SimpleITK

cd ~
mkdir SimpleITK-build
cd SimpleITK-build

这里我使用了CMake图形用户界面(在Ubuntu上，用sudo apt-get install cmake-qt-gui获取它)，

cmake-gui ../SimpleITK/SuperBuild/

这将打开一个GUI，您可以在其中编辑cmake变量。单击Configure按钮并在弹出的对话框上单击Finish，然后启用Advanced。更改所有相关的Python变量：

​

​

(我不知道为什么有些路径在结尾处有“m”，但您可以阅读更多关于它的这里)。

如果要关闭Java或任何其他语言，请向下滚动并禁用WRAP_JAVA。再次按Configure (不确定这是否必要)，然后按Generate。关闭CMake图形用户界面，返回到您的终端并输入

make

至少要花一个小时。

现在将这一行添加到.bashrc文件中

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/SimpleITK-build/lib

安装在Python上

我使用checkinstall干净地管理安装，

cd ~
sudo checkinstall --pkgname python3-simpleitk  python3.4 \
~/SimpleITK-build/SimpleITK-build/Wrapping/PythonPackage/setup.py install

Answer 2

我会首先检查最新的标签版本，它很难知道什么在回购在任何特定的时间，如果你不是在一个标记的分支。使用git标记查看哪些是可用的，然后执行以下操作：

git checkout v0.8.0

要优化正确的证书，您可能应该做ccmake而不是cmake。然后进行两次配置(c)，然后生成(g)。如果您不打算使用java、tcl和R，您可能会禁用它们。检查您的python库并包含匹配的python3.4 (PYTHON_INCLUDE_DIR、PYTHON_LIBRARY、PYTHON_EXECUTABLE，使用't‘查看高级选项)。