Rpy2的操作限制是什么？

Question

我了解基本的python编程，因此希望继续使用python路径。问题是，有许多R包吸引我作为一个社会科学人。Rpy2是否允许充分使用任何一般的任意r包，或者是否存在捕获。它在实践中的效果如何？

如果Rpy2太有限，我将不幸地不得不分支到r，但我宁愿不这样做，因为额外的开销。

谢谢泰

Answer 1

把假定的限制带出来。

Rpy2在其较低的级别( rpy2.rinterface级别)公开了R的很大一部分。从技术上讲，与R本身相比，rpy2可以做得更多(为R编写C扩展可能是追赶的唯一方法)。作为一个有趣的事实，从rpy2做"R东西“比从R本身做同样的事情要快(参见rpy2文档基准测试R向量中元素的访问)。

rpy2中的更高级别(rpy2.robject级)增加了一个层，使“做R的东西”更"pythonic“(尽管放弃了上面提到的性能要求)。R包看起来像Python模块，有一些类，如公式、因子等.若要将所有R对象作为Python类，则有一个转换系统允许将一个复杂的R结构自动映射到Python对象(参见lme4在rpy2 documentation0中的示例，动态转换无效的R变量名(‘.“)。是R中变量名的有效字符)，从R文档中动态创建Python文档字符串。

Answer 2

我建议你用RPy2和IPythons %rmagic。

然而，RPy2并不是Python的统计函数的替换或端口或R库。这基本上是从Python内部调用R的简单方法(在后台启动R解释器)。您可以在R和Python之间传递基本数据--结构(numpy数组等)，但更专门的结构(例如R的动物园或xts对象)可能会导致问题。

最后，您仍然需要了解R的语法等才能使用RPy2。与Python中的R-对象交互是很好的，但是您仍然需要了解很多关于R-对象的知识。