在Linux中安装r包

Question

我试图使用以下命令在Ubuntu中安装一个R包：

R CMD INSTALL rpart_4.1-5.tar.gz
install.packages("/home/rpart_4.1-5.tar.gz", repos = NULL, type="source")

* installing to library '/R/library'
* installing *source* package 'rpart' ...
** package 'rpart' successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
sh: make: command not found
ERROR: compilation failed for package 'rpart'
* removing '/R/library/rpart'

我安装了GCC 4.8.2，命令gcc -v提供了以下输出：

Using built-in specs.
COLLECT_GCC=gcc
COLLECT_LTO_WRAPPER=/tools/stow/gcc-4_8_2-2.x86-64.linux.centos.5/bin/../libexec/gcc/x86_64-unknown-linux-gnu/4.8.2/lto-wrapper
Target: x86_64-unknown-linux-gnu
Configured with: ../gcc-4.8.2/configure --prefix=/mnt/gcc/buildir/gcc-4.8.2
Thread model: posix
gcc version 4.8.2 (GCC)

上一次面对同样的问题，安装GCC (相同版本)解决了这个问题(在这个话题上发布了类似的关于堆栈溢出的查询)。然而，这一次，它是行不通的。谁能告诉我是什么原因造成了这个问题吗？

更新：我们正在尝试手动安装依赖项以查看它是否有效。我们安装了Make和GCC 4.8.2：

但是，我仍然得到以下错误：

* installing to library '/opt/vertica/R/library'
* installing *source* package 'rpart' ...
** package 'rpart' successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
cc -std=gnu99 -I/opt/vertica/R/include -DNDEBUG -I/usr/local/include -fpic -c anova.c -o anova.o
make: cc: Command not found
make: *** [anova.o] Error 127
ERROR: compilation failed for package 'rpart'
* removing '/opt/vertica/R/library/rpart'

除了Make和GCC，我们还需要安装其他的依赖项吗？

Answer 1

您的系统没有编译的实用程序。

请执行以下命令在您的系统中安装make。

 sudo apt-get install build-essential

Answer 2

如果你就这么做

 sudo apt-get install r-base-dev

您所有与R包构建相关的关键依赖项，这就是您在这里想要的。这包括编译器、make等作为built-essential的一部分，以及R.所需的特定库。我们创建这个包的原因是:)

如果您的机器没有永久的互联网接入，请查找先前问过的关于"apt-get无网络访问“等问题。