R中的实验设计:平衡不完全块设计

Question

我想要生成一个矩阵来计划一个实验。

• 我有6个人和6种治疗在6天内交付。
• 我每周可以使用一个人(总共6天的6周= 36天的测试，每天6次)。
• 每一天，我都会按随机顺序对个人进行6次测试。个人不应在一周的任何一天开始接受同样的治疗。

例如：

Monday: A C D B E F
Tuesday: C E A B F D
...

• 如果可能的话，不同的个人不应该有与其他人相同的顺序。
• 我想考虑顺序处理；也就是说，每对相互跟踪的治疗都应尽可能频繁地重复，以避免“结转”(顺序和顺序)效应。目前我正在与R一起工作，但也可以使用MATLAB。

我试着设计出一个包装“农业”和包装“交叉”，但到目前为止没有成功。我的想法是采用平衡的、不完整的区块设计。下面是我的一个代码的示例。

> trt <- c("A", "B", "C", "D", "E", "F" )
> k <- 6
> outdesign<- design.bib (trt, k, seed=0)
Error in md[i, bi] : incorrect number of dimensions

Answer 1

你用错了函数。您需要完整的块设计(design.rcbd)，而不是不完整的设计。不完整的块设计将创建块，其中只包括一些治疗。因此，对于design.bib，k< length(trt)。

编辑:这将给你6个科目6天。强迫每一天都以不同的方式对待每一个问题，这比我现在有时间做的要多，但也许在我讲到之前，别人会回答你的。

trt <- c("A", "B", "C", "D", "E", "F" )
N <- 6
days <- 6

outdesign<-as.data.frame(matrix(nrow=N*length(trt),ncol=days+1))
names(outdesign)<-c("Subj", "Day1", "Day2", "Day3", "Day4", "Day5", "Day6")
outdesign$Subj<-rep(1:6,each=length(trt))
for (i in 1:days) {
  outdesign[,i+1]<- design.rcbd(trt, N, seed=0,first=TRUE)$book$trt
}

   Subj Day1 Day2 Day3 Day4 Day5 Day6
1     1    E    F    D    C    C    C
2     1    C    E    E    F    F    E
3     1    D    C    B    A    E    D
4     1    B    D    F    D    A    A
5     1    A    B    C    B    D    F
6     1    F    A    A    E    B    B
7     2    D    C    F    A    F    F
8     2    B    E    B    C    E    B
9     2    C    D    E    E    D    A
10    2    A    F    A    F    B    E
11    2    F    A    D    B    C    D
12    2    E    B    C    D    A    C
13    3    B    C    C    A    B    F
14    3    A    A    E    F    E    E
15    3    C    E    F    B    A    B
16    3    E    B    A    C    F    A
17    3    F    F    B    D    C    C
18    3    D    D    D    E    D    D
19    4    F    C    F    D    F    E
20    4    D    B    A    E    B    D
21    4    B    F    D    A    A    F
22    4    C    A    B    B    D    B
23    4    E    E    E    C    C    C
24    4    A    D    C    F    E    A
25    5    D    E    F    A    A    F
26    5    A    D    E    E    E    B
27    5    C    C    C    D    D    E
28    5    E    F    B    C    C    C
29    5    B    A    A    F    B    A
30    5    F    B    D    B    F    D
31    6    F    F    A    F    C    F
32    6    A    D    E    E    D    B
33    6    C    B    C    D    A    A
34    6    B    C    F    C    F    C
35    6    E    E    B    A    E    D
36    6    D    A    D    B    B    E