在莱克斯用Knitr作图

Question

我想在莱克斯用Knitr来策划。当我跑的时候

<<>>=
install.packages("ggplot2")
library(ggplot2)
qplot(y=y, x=1:1000, main = 'Log-Likelihood')
@

我知道错误了

LaTeX Error: File `figure/unnamed-chunk-6.eps.bb' not found.

我尝试过在起始括号中添加扩展，但没有成功。我怎么得到我的阴谋？

在第一个答复之后，试着这样做：

定义函数(不是很重要，只是为了说明我是如何得到y的)

<<>>=
exp.loglik <- function(lambda, obs){   
    xbar = mean(obs)   
    return(length(obs)*log(lambda)-lambda*xbar) 
}
@

定义y(不是很重要，只是为了说明y是如何定义的)

<<>>=
y = rep(NA,1000) 
for (i in 1:1000){   
    y[i] = exp.loglik(lambda=i/10000, obs=diet_data$survtime)   
}
@

运行的代码，然后发生错误(请注意，我按照指示在纯R中安装了包)

<<warning=FALSE, message=FALSE, echo=FALSE>>=
library(ggplot2)
qplot(y=y, x=1:1000, main = 'Log-Likelihood')
@

同样的错误: LaTeX错误:没有找到文件‘图/未命名-块-6.eps.bb’。

Answer 1

首先，单独安装包，只在纯R中运行install.packages，其次，不定义y。

下面是一个最小的示例，它生成一个不显示R代码、警告或消息的情节：

<<warning=FALSE, message=FALSE, echo=FALSE>>= 
library(ggplot2) 
qplot(y=10:1, x=1:10, main = 'Log-Likelihood') 
@

编辑

我正在运行以下代码：

<<>>= 
exp.loglik <- function(lambda, obs) {        
  xbar = mean(obs)        
  return(length(obs)*log(lambda)-lambda*xbar)  
}
@

<<>>= 
y = rep(NA,5)  
for (i in 1:5) {        
  y[i] = exp.loglik(lambda=i/5, obs=runif(5))    
} 
@

<<warning=FALSE, message=FALSE>>= 
library(ggplot2) 
qplot(y=y, x=1:5, main = 'Log-Likelihood') 
@

我得到一张照片。你的代码在干净R中工作吗？只是重新运行，以确保它是。如果那里一切都好的话，那可能是一些乳胶/针织品的装置。