运行一个R脚本文件夹，每个文件夹位于不同的R实例中

Question

我有一个需要运行的脚本文件夹，但是我需要并行运行它们。

我如何运行一个文件夹的R脚本，每一个在一个不同的实例R？例如：10个R脚本同时运行在10个R实例上。

以前我只手动打开R 10次，然后通过复制和粘贴来运行每个脚本，但是我想知道是否有一种方法可以自动完成这个操作？

我不一定需要在R-我是开放使用其他语言。

Answer 1

这是一种只使用R的解决方案，无论操作系统是什么，都应该工作：

Rfiles <- dir("your.folder", pattern="\\.[R|r]$", full.names=TRUE)
library(parallel)
clus <- makeCluster(length(Rfiles))
parLapply(clus, Rfiles, source)

Answer 2

要完成您所描述的任务，一个非常简单的方法是使用一个bash脚本，如下所示：

for R_FILE in $(ls *.R)
do
    R CMD BATCH $R_FILE &
done

如果您正在使用Windows，您将需要安装Cygwin的东西，但在Linux或Mac上，您可以使用。

Answer 3

您可以使用shell中的Rscript。如何运行多个同时命令是shell特定的。例如，这将适用于bash：

Rscript file1.R &
Rscript file2.R &