在Linux上启用OpenMPI

Question

我正在尝试使用OpenMPI在Ubuntu上启用CodeBlocks。我已经下载了：

sudo apt-获取安装-y autotools-dev g++ build-必要的openmpi1.6-bin openmpi1.6-doc libopenmpi1.6-dev

之后，我尝试运行以下代码：

#include <stdio.h>
#include <mpi.h>

int main(int argc, char **argv)
{
   int size, rank;
   MPI_Init(&argc, &argv);
   MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
   MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
   printf("SIZE = %d RANK = %d\n",size,rank);
   MPI_Finalize();   
   return(0);
}

但我发现了一个错误：

致命错误: mpi.h:没有这样的文件或目录

然后，我将c++编译器从g++更改为mpicxx，这是这里推荐的：常见问题:编译MPI。

但是，当我现在试图运行我的代码时，我会得到以下几个错误：

openmpi.cpp|| undefined reference to `MPI_Init'|
openmpi.cpp|| undefined reference to `ompi_mpi_comm_world'|
openmpi.cpp|| undefined reference to `MPI_Comm_size'|
openmpi.cpp|| undefined reference to `ompi_mpi_comm_world'|
openmpi.cpp|| undefined reference to `MPI_Comm_rank'|
openmpi.cpp|| undefined reference to `MPI_Finalize'|
[...]

我想，我必须添加路径或链接库，但我不知道如何实现这一点。我也不知道在我的机器上安装了OpenMPI。

我已经从网站下载的文件夹，以及，如果这可以帮助。

更新

在将mpicxx作为附加标志添加到链接器和-pthread -L/opt/openmpi/lib -lmpi_cxx -lmpi -ldl -lm -Wl,--export-dynamic -lrt -lnsl -lutil -lm -ldl之后，我最终可以编译代码。

但现在我又犯了一个错误：

[[INVALID],INVALID] ORTE_ERROR_LOG: A system-required executable either could not be found or was not executable by this user in file ess_singleton_module_c at line 231
[...]
Soory! You were supposed to get help about:  
orte_init:startup:internal-failure  
But I couldn't open the file:  
/usr/share/openmpi/help-orte-runtime: No such file or directory.

Answer 1

大多数MPI库都带有特殊的编译器包装器，例如：

• C编译器的mpicc；
• mpic++/mpiCC/mpicxx用于C++编译器；
• Fortran编译器的mpif77/mpif90/mpif95；
• 其他特定于发行版的包装器，例如英特尔C编译器的英特尔MPI库的mpiicc。

这些包装器提供编译器需要的所有选项，以便找到包含的文件并链接适当的库。

因此，您必须更新项目设置，并将、编译器和链接器都更改为。

另一个选项是运行以下命令：

mpicxx -showme:link

它将为您提供一个选项列表，您应该将这些选项添加到项目设置中的链接器标志中，以便正确地将可执行文件与Open链接。