Optparse选项操作

Question

我正在使用opt解析式，我正在编写一个带有3个命令行参数的脚本。第一个(-qtype)指定信息是需要从本地文件调用还是从web调用。根据这一点，第二个参数(-qname)要么是一个核苷酸串，要么是一个FASTA文件名。第三个参数(-output)是输出文件名。

我的问题是，如果有一个optparse选项操作，我可以使用第一个参数(因为标准的“存储”，“附加”等不适用于本例)。

到目前为止，我的情况如下：(很可能有错误)

import optparse

if False:#__name__== '__main__':
    # parser object for managing input options
    parser = optparse.OptionParser()

    parser.add_option( '-qtype' ,  action = ‘?’ )
    parser.add_option( '-qname' , action = ‘?’ , […] )
    parser.add_option( '-output' , action = ‘store’ , type = ‘?’ , dest = ‘filename’ )

    # load the inputs
    args = [‘-qtype’ , ‘-qname’ , ‘-output’]
    (options , args) = parser.parse_args()

我有问号还有..。我正纠结于如何处理这个问题。

Answer 1

选项1:使用参数而不是选项

这可能是一种可行的方法，因为您可能需要用户的所有三个输入才能正常运行。

根据Opt解译文档

一个程序应该能够在没有任何选择的情况下运行得很好。

在这种情况下，您的解决方案希望

import optparse
import sys

if __name__ == '__main__':
    parser = optparse.OptionParser()

    (options, args) = parser.parse_args()

    if len(args) != 3:
        print 'please specify all required arguments - qtype qname output_file'
        sys.exit(-1)

    qtype, qname, output = args

    if qtype == 'web':
        pass
    elif qtype == 'local':
        pass
    else:
        print 'no qtype specified! exiting'
        sys.exit(-1)

然后，您可以将所有参数作为字符串使用，或者直接处理它们，或者将它们转换为web请求的文件/ url。

示例命令行：

program.py  web  blah blah

选项2:无论如何使用选项

import optparse
import sys

if __name__ == '__main__':
    parser = optparse.OptionParser()

    parser.add_option('--qtype', action='store', dest='qtype', type='string')
    parser.add_option('--qname', action='store', dest='qname', type='string')
    parser.add_option('--output', action='store', type='string', dest='filename')

    (options, args) = parser.parse_args()
    if options.qtype == 'web':
        pass
    elif options.qtype == 'local':
        pass
    else:
        print 'no qtype specified! exiting'
        sys.exit(-1)

示例用法：

program.py --qtype web --qname blah --output blah