我有一个文件，我需要在regex 'LN:‘之后从第二行提取一个特定的字符串。

Question

请参考下面的文件内容。

    @HD VN:1.0  SO:unsorted
    @SQ SN:Chr1 LN:30427680
    @PG ID:bowtie2  PN:bowtie2  VN:2.1.0

如何使用awk或任何其他unix命令仅提取数字30427680。

Answer 1

使用grep：

grep -oP 'LN:\K.*' filename

Answer 2

只需使用grep：

grep -o 30427680 file

-o, --only-matching
         Prints only the matching part of the lines.

Answer 3

使用珀尔：

perl -ne 'print $& if /LN:\K.*/' filename

或

perl -ne 'print $1 if /LN:(.*)/' filename