read.table函数与stdin

Question

我有一个标签分隔的文本文件，我试图用read.table函数加载到R中。脚本的前几行如下所示

#!/usr/bin/env Rscript
args <- commandArgs(trailingOnly=TRUE)
data <- read.table(args[1], header=TRUE, sep="\t", quote="")
# process the data

这个很管用。我最初试图让R从标准输入中读取数据，但没有成功。我的第一个方法..。

#!/usr/bin/env Rscript
data <- read.table(stdin(), header=TRUE, sep="\t", quote="")
# process the data

.看上去一点用都没有我的第二个方法..。

#!/usr/bin/env Rscript
data <- read.table("/dev/stdin", header=TRUE, sep="\t", quote="")
# process the data

...read数据文件但是(由于某种原因我不明白)前20行出现故障，这是一个大问题(特别是因为这些行包含头信息)。有没有办法让read.table从标准输入中读取？我是不是漏掉了什么显而易见的东西？

Answer 1

?stdin说：

stdin()指的是‘控制台’，而不是进程的C级‘stdin’。区别在GUI控制台(它们可能没有活动的‘stdin’，如果它们这样做了可能不会连接到控制台输入)和嵌入式应用程序中也很重要。如果您希望访问C级文件流“stdin”，请使用file("stdin")。

和：

当R从文件中读取脚本时，该文件就是“控制台”：这是允许内联数据…的传统用法。

这可能是观察到的行为的原因。原则上，您可以从标准输入read.table -但在大多数(几乎所有？)案例你会想要通过file('stdin')做到这一点。