当从Python脚本调用时，Perl没有完全执行。

Question

我有一个Python脚本，它调用一个解析一些文件并生成输出文件的Perl脚本。同样，使用Python将这些输出文件上载到MySQL数据库中。Perl脚本使用5-7 mins来解析一些文件并生成输出文件，这些输出文件是Python用来上传的。

Python脚本类似于：

import subprocess
pipe = subprocess.Popen(["perl", "./parser.pl"], stdin=subprocess.PIPE)
pipe.stdin.close()

#Now, load the output files from parser.pl to database.

sql01 = """LOAD DATA LOCAL INFILE 'sequence.parsed' INTO TABLE nasequenceimp FIELDS TERMINATED BY '\t' OPTIONALLY ENCLOSED BY '"' LINES TERMINATED BY '\n';"""

try:
  c.execute(sql01)
  conn.commit()
except StandardError, e:
  print e
  conn.rollback()

但是，Python脚本似乎被终止，Perl脚本继续解析文件。因此，Python生成错误sequence.parsed does not exist。

为什么Python脚本不等待Perl完成执行？

Answer 1

父进程不等待subprocess.Popen默认生成的子进程。你应该打电话给：

pipe.wait()

在subprocess.Popen之后。它将等待子进程终止并让您的python脚本继续。

或者你可以直接用os.system()代替。