不加载包的R函数调用

Question

我想使用来自生物导体包hypergraph和hyperdraw的函数，而不加载包。从hyperdraw中运行示例时

dh1 <- hypergraph::DirectedHyperedge("A", "B", "R1")
dh2 <- hypergraph::DirectedHyperedge(c("A", "B"), c("C", "D"), "R2")
hg <- hypergraph::Hypergraph(LETTERS[1:5], list(dh1, dh2))
hgbph <- hyperdraw::graphBPH(hg)

我知道错误：

Error in hyperdraw::graphBPH(hg) : could not find function "hyperedges"

如果我尝试加载hyperedges

hyperedges <- hyperdraw:::hyperedges

我知道错误了

Error in get(name, envir = asNamespace(pkg), inherits = FALSE) : 
  object 'hyperedges' not found

当我使用library或require加载两个包时，没有错误(在没有hypergraph::和hyperdraw::的情况下运行上述代码)。

我不想加载包的原因是，我正在构建一个只在一个函数中使用hyperdraw和hypergraph的包，我宁愿将这些包放入Suggests中，也不愿将这些包放到DESCRPTION文件中的Depends中。

有谁知道怎么解决这个问题吗？

Answer 1

超图在它的描述文件中有这个

Depends:      R (>= 2.9.0), methods, grid, graph, hypergraph, Rgraphviz

它依赖于在hypergraph::hyperedges路径上找到search()。就我个人而言，我认为超图应该包括一条线

importFrom(hypergraph, hyperedges)

在它的命名空间文件中。目前，最好的做法是添加依赖项:对描述文件和importFrom(hyperdraw, <whatever functions you need>)进行超图绘制。我已经联系了超图的维护者，要求他们按上面的方式更新名称空间；然后您只需使用Imports: hyperdraw即可。我认为您只是在为自己工作，并试图使用建议或其他方法来颠覆对正式依赖的需求，从而使用户感到沮丧。