我正在尝试使用fit curve_fit来拟合我的数据的高斯函数,在网络上有很多有用的例子,我试着让几个工作,但没有结果。我用虚构的数据编写了一个简单的脚本来诊断问题。简而言之,curve_fit没有做任何拟合,函数只是返回初始参数值,不管它们离实数有多近。下面是简单脚本的代码:
# -*- coding: utf-8 -*-
import numpy
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.mlab as mlab
from scipy import optimize
##Fit
def Fit( datax, datay ):
# define your function:
def f(x, *p):
p = m, b
return m*numpy.asarray(x) + b
m = 0.4
b = 2.4
p_init = [m, b]
Initial_model = f(datax, [m, b])
plt.plot(datax, Initial_model, label='Initial Model')
plt.title("Initial Model")
# plt.title('Initial Model')
# plt.show()
# fit! (given that data is an array with the data to fit)
print optimize.curve_fit(f, datax, datay, p_init)
coeff, var_matrix = optimize.curve_fit(f, datax, datay, p_init)
global fit
fit = f(datax, *coeff)
plt.plot(datax, fit, 'r-')
plt.show()
print 'Fitted slope 1 = ', coeff[0]
print 'Fitted intercept 1 = ', coeff[1]
return fit
##Plot
def Plot( datax, datay, fit ):
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111)
plt.plot(datax, datay, 'b*')
l = ax.plot( datax, fit, 'r-', linewidth=2)
ax.set_xlabel('Rate')
ax.set_ylabel('Return')
ax.set_title("Test")
ax.autoscale(enable=True, axis='both', tight=None)
ax.grid(True)
plt.show()
##data
datax = numpy.array([7.02, 20.06, 13.78, 16.92, 10.17], dtype=numpy.float64)
datay = numpy.array([5.14, 10.66, 8.44, 9.64, 6.79], dtype=numpy.float64)
##analyze
Fit( datax, datay )
Plot( datax, datay, fit )
Out:
(array([ 0.4, 2.4]), inf)
Fitted slope 1 = 0.4
Fitted intercept 1 = 2.4我尝试过的东西:-using最不直接:同样的问题,-reinstalling参与:没有改变
我在Windows 7上使用Anaconda。
有什么问题吗?
发布于 2013-07-31 00:06:18
您对f()的定义是奇怪的,并不能做您想做的事情。您将m和b分配给p,从而覆盖传入的任何内容。这就是为什么参数永远不会改变的原因,因为它们不会改变!
没有必要以一种特殊的方式来定义f(),只需按照通常的方式定义参数就可以了。对于您简单的拟合线的情况,我们可以使用
def f(x, m, b) :
return m*x + b唯一需要的其他改变是
Initial_model = f(datax, *p_init)你的代码就会运行。
https://stackoverflow.com/questions/17953735
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