NCO/pynco: ncea无法从Python中找到文件

Question

我正在尝试从python内部运行ncea，从多年的数据中获取每日文件的月平均值。

命令：

ncea -v analysed_sst,sea_ice_fraction /mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/200301*.nc 200301-gp-monthly.nc

在终端上运行良好。

但在Python中，我得到了以下错误：

call(["ncea","-v","analysed_sst,sea_ice_fraction","/mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/200301*.nc",monthly_file])
ncea: ERROR file /mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/200301*.nc neither exists locally nor matches remote filename patterns

我也试过了：

nco.ncea(input="/mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/200301*.nc",output=monthly_file).variables['analysed_sst','sea_ice_fraction']

并得到相同的错误。

我不知道这是NCO的问题还是Python的问题。

当我只使用两个文件来查看问题是否来自通配符时，我得到了相同的错误。

例如：

input_string="/mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/20030201000000-STAR-L4_GHRSST-SSTfnd-Geo_Polar_Blended_Night-GLOB-v02.0-fv01.0-0-360.nc /mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/20030202000000-STAR-L4_GHRSST-SSTfnd-Geo_Polar_Blended_Night-GLOB-v02.0-fv01.0-0-360.nc"


call(["ncea","-v","analysed_sst,sea_ice_fraction",input_string,monthly_file])
ncea: ERROR file /mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/20030201000000-STAR-L4_GHRSST-SSTfnd-Geo_Polar_Blended_Night-GLOB-v02.0-fv01.0-0-360.nc,/mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/20030202000000-STAR-L4_GHRSST-SSTfnd-Geo_Polar_Blended_Night-GLOB-v02.0-fv01.0-0-360.nc neither exists locally nor matches remote filename patterns

我不知道语法应该是什么。如果我这样做，我会得到相同的错误：

input_string="file1,file2"
input_string="file1 file2"
input_string="file1\ file2"

如果我尝试使用列表，就像glob.glob返回的那样：

input_string=["file1","file2"]

我得到了：

TypeError: expected str, bytes or os.PathLike object, not list

谢谢!

Answer 1

所以在找到这个问题之后：Using all elements of a list as argument to a system command (netCDF operator) in a python code

我终于想通了：

input_string="/mnt/r01/data/goes-poes_ghrsst/daily/200301*.nc"
monthly_file="200301-gp-monthly.nc"
list1=['ncea','-v','analysed_sst,sea_ice_fraction']
list2=glob.glob(input_string)
command=list1+list2+[monthly_file]
subprocess.run(command)