MPI_Barrier在Ubuntu中不能正常工作

Question

我是使用MPI的初学者。在这里，我编写了一个非常简单的程序来测试MPI能否运行。这是我的头盔。

#include <stdio.h>
#include <mpi.h>

int main(int argc, char *argv[]) {
  int numprocs, rank, namelen;
  char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];

  MPI_Init(&argc, &argv);
  MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &numprocs);
  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
  MPI_Get_processor_name(processor_name, &namelen);
  MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD);
  printf("Process %d on %s out of %d\n", rank, processor_name, numprocs);

  MPI_Finalize();
}

我用节点来测试，主机文件是: node1 node2

所以我有两台叫做node1和node2的机器。我可以在没有密码的情况下互相交流。

我通过键入：mpirun -np 2 -f hostfile ./hello启动程序。

可执行文件hello位于两台机器的同一个目录中。

然后，在我跑完之后，我得到了一个错误：

PMPI_Barrier中的致命错误:其他MPI错误，错误堆栈:PMPI_Barrier(425).：MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD) Failure MPIR_Barrier_impl(331).：MPIR_Barrier_impl(313).：MPIR_Barrier_intra(83).：dequeue_and_set_error(596)：PMPI_Barrier中具有0级致命错误的通信错误:其他MPI错误，错误堆栈:PMPI_Barrier(425).：MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD) Failure MPIR_Barrier_impl(331).：MPIR_Barrier_impl(313).：MPIR_Barrier_intra(83).：dequeue_and_set_error(596)：等级为1的通信错误

如果我注释掉MPI_Barrier()，它可以正常工作。好像机器之间的通讯有问题吗？还是我没有正确安装openmpi？有什么想法吗？

我用的是Ubuntu 12.10

我得到了一些提示:这在MPICH2中不能很好地工作，如果我使用openmpi，那么它就能工作。我只是通过sudo apt安装mpich2来安装MPICH。我错过了什么吗？mpich2的大小比openmpi小得多

Answer 1

在/etc/host中，一些Linux发行版的更新版本在文件的顶部添加了以下类型的行：

127.0.0.1 localhost
127.0.0.1 [hostname]

这应该被更改，以便主机名行包含您的实际IP地址。如果您不使用以下错误进行此更改，则MPI hydra进程将中止：

Fatal error in PMPI_Barrier: Other MPI error, error stack:
PMPI_Barrier(425)...........: MPI_Barrier(MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Barrier_impl(292)......: 
MPIR_Barrier_or_coll_fn(121): 
MPIR_Barrier_intra(83)......: 
dequeue_and_set_error(596)..: Communication error with rank 0