as.dendrogram中的误差

Question

我正在尝试用大数据制作一个树状图。

我正在使用stats，phyclust库，

distances <- phyclust.edist(Data[,],edist.model = .edist.model[3]) 
dataHClust <- hclust(distances, "ave")
dhc <- as.dendrogram(dataHClust)

hclust工作得很好，我可以绘制它，它可以正确地绘制它。在我使用as.dendrogram函数之后，它不会给我一个错误。但当我要么：

• 试着画出来
• 使用dendrapply应用函数。

上面写着：

Error in lapply(args, is.character) : node stack overflow 
Error in dev.flush() : node stack overflow

as.dendrogram不能处理大型数据集(~30000)的问题吗？如果是的话，是否有替代办法？

Answer 1

我认为这是绘制大型数据集的一个问题，因为我能够让您的代码在一个小数据集中运行。

您可以尝试切割树状图以使其与h或as.dendrogram中的height参数相匹配。