使用Rscript，是否有一种适当的方法来抑制非脚本输出？

Question

可能重复： R suppress startupMessages from dependency

我读过关于使用sink("NUL") / sink("/dev/null")的文章，但它们都没有解决我遇到的问题。即使我将library()命令包装在sink("NUL")和sink()中，我对Rscript的调用也输出了我不想看到的所有信息：

Loading required package: Matrix
Loading required package: methods
Loading required package: lattice
Loaded glmnet 1.8

Loading required package: MASS
Loading required package: lme4

Attaching package: 'lme4'

The following object(s) are masked from 'package:stats':

    AIC, BIC

Loading required package: R2WinBUGS
Loading required package: coda

Attaching package: 'coda'

The following object(s) are masked from 'package:lme4':

    HPDinterval

Loading required package: abind
Loading required package: foreign

arm (Version 1.5-05, built: 2012-6-6)

Working directory is C:/Users/andrews/bootstraps/user/_branches/ER-PoC/Bootstraps/R


Attaching package: 'arm'

The following object(s) are masked from 'package:coda':

    traceplot

[1] "client=51"         "date='01-01-2011'"
[1] "01-01-2011"
[1] 51

最后的内容是我真正想要的唯一输出，也是我似乎能够用sink()命令抑制的唯一输出。实际上，似乎应该有一个Rscript参数来抑制这个输出(如果我在控制台中source脚本，它甚至不会显示出来).有意见吗？

Answer 1

安德鲁，我遇到了同样的情况，suppressMessages()并没有删除所有额外的输出，但是使用sink()形式的capture.output()包装了suppressMessages()工作。

$ rscript --vanilla -e 'library(Rmpfr)'
Loading required package: methods
Loading required package: gmp
---->8----
Loading C code of R package 'Rmpfr': GMP using 32 bits per limb
---->8----


$ rscript --vanilla -e 'suppressMessages( library(Rmpfr) )'
Loading C code of R package 'Rmpfr': GMP using 32 bits per limb


$ rscript --vanilla -e 'msg.out <- capture.output( suppressMessages( library(Rmpfr) ) )'

加载Rmpfr包时发生的事情是使用message连接编写的几条行为良好的启动消息，以及使用output连接编写的不太好的消息。当然，您可以自己创建和操作一个sink()，但这正是capture.output()已经要做的。

也许设置一个冗长的arg来获得更多的控制是有帮助的：

$ cat sample.R
#!/c/opt/R/R-2.15.0/bin/rscript --vanilla

cmd_args <- commandArgs( TRUE );

if( length( cmd_args ) > 0 ) {
  eval( parse( text = cmd_args[1] ) )
}

if( exists( "verbose" ) ) {
  library( Rmpfr )
} else {
  msg.trap <- capture.output( suppressMessages( library( Rmpfr ) ) )
}

print("Hello")

产生的结果：

$ ./sample.R
[1] "Hello"


$ ./sample.R "verbose=TRUE"
Loading required package: methods
Loading required package: gmp

Attaching package: 'gmp'
---->8----
[1] "Hello"

很多东西你可以在那里玩，但至少你可以看到如何完全抑制msg输出。

希望能帮上忙。玩得开心!