具有高级可视化的python下的ABM

Question

很抱歉，如果这一切看起来都是nooby和不清楚，但我目前正在学习网络标志，以模型代理为基础的集体行为，并希望听到一些替代软件选择的建议。我的主要工作是，我非常想利用PyCuda，因为据我所了解，它支持并行计算。然而，这是否意味着我仍必须在其他环境中编写数字脚本，并在另一个环境中实现可视化？

如果是的话，我的问题是：

1. 我应该用什么数字包？PyEvolve，DEAP，还是别的什么？PyEvolve似乎不再被开发，而DEAP只是过时的(？)EAP。
2. 从图形上看，我发现mayavi2和vtk很有前途。问题是，所有的数字方案似乎都无法轻易地与这些数据相结合。没有比将数值输出保存到数据文件并将其输入mayavi2更好的选择了吗？
3. 另一种选择是通过Netlogo生成数据，并将它们从(2)中输入图形包。这样做有什么坏处吗？

非常感谢你对这件事的理解。

Answer 1

除非遇到严重的性能问题，否则您几乎肯定不想使用CUDA。一般来说，CUDA是解决浮点线性代数问题的最佳方法。如果您正在寻找一个围绕并行计算构建的框架，我希望使用OpenCL，如果需要的话，它可以利用GPU。

在可视化方面，我强烈建议以一种特定的数据交换格式为目标，然后让其他程序为您进行这种渲染。我使用类似于VTK的东西的唯一原因是，如果出于某种原因，您需要对可视化过程进行更多的控制，或者您正在寻找一个实时解决方案。

Answer 2

可视化的最佳选择可能是使用中间格式，并在另一个程序中这样做。但是为了性能，我宁愿为集群配置JVM并在其上运行NetLogo。我还没有尝试过它，但是我正在认真地考虑在Beowulf风格的集群上尝试NetLogo。

顺便说一句，如果您计划用Python实现代码，那么有一个名为就餐的ABM平台，即据说有Python接口。