从java调用R语言/脚本

Question

我们如何从java调用R语言/R脚本？基本上，我需要用java来包装R脚本。

1. 数据将提供给java层say setData(double[])，然后将其发送给R脚本--让我们说setDataR(double [])方法。
2. R脚本将执行一些计算，比如调用方法double[] computeR()。
3. Java程序将通过调用double[] getData()获得计算结果，后者反过来委托R脚本获取计算数据。

如何由JRI、Rserv、Rcaller来执行？我没有看到调用Rscript方法的任何方法？请寄样品。它应该模拟JNI (java，C++)调用。

1. 在jvm中，我认为多线程不能调用R脚本吗？附近有工作吗？

谢谢

Answer 1

使用Java中的R最简单的方法是使用Runtime.exec("")，获取响应并解析它。关于如何运行本机指令的一个典型示例是：

Process p = Runtime.getRuntime().exec("ls");
BufferedReader stdInput = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getInputStream()));
BufferedReader stdError = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getErrorStream()));

从这里，您可以读取并处理输出到缓冲到stdInput中的标准输出的结果。

Answer 2

RCaller完全可以做你想做的事。假设您有一个双数组'a‘，定义为

double[] a = new double[] {1.0, 2.0, 3.0};

你想要计算平均值，中位数和标准差值。创建RCaller的新实例

RCaller caller = new RCaller();
Globals.detect_current_rscript();
caller.setRscriptExecutable(Globals.Rscript_current);

RCode code = new RCode();


code.addDoubleMatrix("a", a);
code.addRCode("s <- list(mean=mean(a), median=median(a), sd=sd(a))");

caller.setRCode(code);

caller.runAndReturnResult("s");

double mean = caller.getParser().getAsDoubleArray("mean")[0];
double median = caller.getParser().getAsDoubleArray("median")[0];
double sd = caller.getParser().getAsDoubleArray("sd")[0];

变量中位数保存从R脚本返回的值2.0。有关详细信息，请访问页面这里