Sweave/R生成的数字以及为什么只有(PDF)LaTeX

Question

我在此继续我先前的文章：

Beginner's questions (figures, bibliography) with Sweave/R/LaTeX---my first document

工作守则转载如下：

\documentclass[a4paper]{article}
\usepackage{Sweave}  %%%%%%
\begin{document}
<<echo=TRUE>>=
x <- rnorm(100)
xm <- mean(x)
xm
@

<<echo=FALSE>>=
x <- rnorm(100)
xm <- mean(x)
xm
@

<<echo=TRUE>>= 
##### Remove all comments from your data file 
test.frame<-read.table(file="apples.d",header=T,sep= "")
names(test.frame)
head(test.frame)
class(test.frame)
@

\begin{figure}[htbp]
\begin{center}
\setkeys{Gin}{width=0.5\textwidth}
<<echo=FALSE,fig=TRUE,width=4,height=4>>=
#### Must tell plot where to get the data from. Could also use test.frame$year
with(test.frame,plot(year,value))
@
\end{center}
\end{figure}
\end{document}

上面的运行与RStudio (最新)和Tinn-R (最新)运行良好，所需的pdf文档被产生。

问题：

1. ，如果我将上面的文件命名为goodex.snw，然后运行Sweave，我就会得到goodex-004.pdf文件，该文件要么是Tinn-R，要么是RStudio作为情节的PDF图像。为什么拖着004？这种情况可以改变吗？
2. 可以生成EPS文件吗？Sweave编译成PDF的工具是否仅通过( PDF )LaTeX，而不是通过传统的DVI > PS >PDF路由？
3. 只是在R命令窗口中运行命令with(test.frame,plot(year,value))，在y轴上生成更多的值，即15000、20000、25000和30000。然而，在这篇文章顶部由我的代码生成的PDF文件中，我没有得到y轴上的所有值(只有15000和25000)。如何在代码中直接控制绘图的大小，以便出现所有必需的y值？

更新:文件apples.d包含：

#Number of apples I ate
year value
8   12050  #year 2008  
9   15292  #year 2009 
10  23907  #year 2010 
11  33997  #year 2011

Answer 1

您的例子是不可复制的，因为我们没有文件apples.d，所以我们只能猜测为什么情节会出错。请参阅：

How to make a great R reproducible example?

关于如何做一个可复制的例子。

请注意，Sweave不是Rstudio或Tinn-R的功能，它是一个R函数(Sweave())，可以从命令行运行，也可以使用R可执行文件的参数运行。这可能有助于了解您是否正在搜索信息。

至于你的问题：

1. 情节的名称总是以FILENAME-CHUNKLABEL.pdf或eps形式出现，其中块标签可以设置为Sweave块的选项(这是第一个参数)。如果不设置块名，则图将为enumerated.
2. You，可以在选项eps=true中使用eps。我非常肯定，在默认情况下，eps和pdf都是生成的。至于编译，Sweave本身并不编译，它创建了一个.tex文件，您可以任意使用该文件。在R2.14中，有一个选项可以在生成的pdfLaTeX文件上自动运行.tex。Rstudio和Tinn-R编译的方式可能是在Sweave之后使用pdfLaTeX调用。您可以手动完成它，如果您想要这样做，differently.
3. Without，一个可重复的例子，我们只能猜测。出什么问题了？您可以使用xlim和ylim参数设置绘图的限制，但这不应该是问题所在。

编辑：

用数据来回答编辑的问题。先给点小费。这种提供数据的方式并不是最有用的方法。当然，我们可以复制它，但是如果您以一种我们可以立即运行的方式给出数据，则会容易得多。例如：

test.frame<-data.frame(year=8:11, value= c(12050,15292,23907,33991))

至于情节，你是说y轴上的标签吗？这可以通过在绘图调用中省略轴并使用axis()函数手动设置来改变：

with(test.frame,plot(year,value,axes=FALSE))
axis(1)
axis(2,test.frame$value,las=1)

这看起来确实有点奇怪，如果蜱不是不断地分布在轴上的话。最好是：

with(test.frame,plot(year,value,axes=FALSE))
axis(1)
axis(2,seq(10000,35000,by=5000),las=1)