MayaVi安装在Qt4上会导致分段故障

Question

我正试图在我的电脑上安装MayaVi。我在一个带有OSX10.6.8，4GB内存的MacBook Air上。

我的python和我的大部分堆栈都是通过自制或pip构建的。特别是对于python2.7、ipython、Qt4、numpy、scipy、vtk等。VTK安装了-python和-qt-extern标志，并且所有的构建都很好。我没有安装wxPython，因为我无法通过pip、手动构建或二进制文件来完成它的工作。

如果我运行ipython -q4thread，我无法成功地执行from mayavi import mlab，因为我得到了一个与PyQt：http://groups.google.com/group/spyderlib/browse_thread/thread/36a35baec74ca144使用两个不同API相关的错误。

但是，如果我单独运行ipython，就可以成功地运行from mayavi import mlab。然后，我尝试遵循下面的示例：http://github.enthought.com/mayavi/mayavi/example_using_with_scipy.html，它包括以下命令：

import numpy as np

def V(x, y, z):
    """ A 3D sinusoidal lattice with a parabolic confinement. """
    return np.cos(10*x) + np.cos(10*y) + np.cos(10*z) + 2*(x**2 + y**2 + z**2)

X, Y, Z = np.mgrid[-2:2:100j, -2:2:100j, -2:2:100j]

from mayavi import mlab
mlab.contour3d(X, Y, Z, V)

这一切都很好，我得到一个窗口弹出，我可以旋转三维图形等。然而，我点击图标打开管道，这将打开另一个窗口。然后教程说双击“等表面”来改变它的属性。一旦我这样做，我就会得到一个可重复的分割错误。

我不知道如何开始找出问题所在。

或者，我可以从命令行运行MayaVi：mayavi2，然后弹出GUI。当我这样做时，我得到以下输出：

Warning: Unable to import the wx backend for pyface due to traceback: Traceback (most recent call last):
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 45, in _init_toolkit
        be = import_toolkit(tk)
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/toolkit.py", line 31, in import_toolkit
        __import__(be + 'init')
      File "/usr/local/Cellar/python/2.7.1/lib/python2.7/site-packages/pyface/ui/wx/init.py", line 14, in <module>
        import wx
    ImportError: No module named wx

虽然GUI确实会弹出，但如果我尝试执行任何操作，则会出现分段错误。

请让我知道，如果您有任何想法，疑难解答，或可能指导重新安装软件包成功。

谢谢!

乌里

Answer 1

我也有一个MacBook空气与OSX10.7.4(狮子)。我在二月花了很多时间让梅拉维发挥作用，最终我成功地制作出了科学的地块。这仍然意味着一些示例和测试无法正确运行，GUI在控制台中产生了大量错误消息，但没有崩溃(大多数情况下)。现在，我成功地破坏了Python安装(可能是通过升级numpy)，所以我需要重新安装。唉，6个月后，事情并没有变得更容易！

仍然没有可行的预编译选项。我从这里尝试了Enthought发行版：http://www.enthought.com/repo/.epd_academic_installers。仍然没有64位版本的ETS，组件是古老的，基于wxPython的mayavi看起来很难看，而且速度慢，反应迟钝。回到brew和pip。经过大量的尝试和错误之后，以下是多少起作用的东西：

1.先决条件

隐藏/卸载已损坏的Homebrew安装：

mv /usr/local/lib/python2.7/site-packages /usr/local/lib/python2.7/site-packages-old 
mv /usr/local/share/python /usr/local/share/python-old
brew uninstall python pyqt pyside vtk

从Xcode (4.4.1)中，选择llvm-gcc作为编译器(我对clang的成功程度较低)：

cd /usr/bin
sudo rm cc c++
sudo ln -s gcc cc
sudo ln -s g++ c++

2.安装

2.1 Python

brew install python --framework --universal

指向新安装：

cd /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions
rm Current
ln -s /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/Current .

如果安装了环境保护署，在/Library/Frameworks/Python.framework/Versions中也需要这样做，否则环保署将优先考虑。

2.2 Numpy

从源安装numpy (pip 1.2目前没有正确安装npymath.ini，这将使npymath.ini无法构建)：

git clone https://github.com/numpy/numpy.git
cd numpy
git checkout v1.6.2
python setup.py install

由于有这么多软件包链接到numpy，所以我确实建议查看官方发布版1.6.2到今天。接下来，使numpy标题可见：

cd /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7
ln -s /usr/local/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/include/numpy .

2.3 qt，pyqt，vtk

安装qt (4.8.2)和pyqt (4.9.4)：

brew install qt
brew install pyqt

还可以安装pyside (1.1.1)

brew install pyside

但这似乎产生了更多的崩溃与梅拉维。无论如何，追加

export QT_API=pyqt

以避免任何混淆。下一步安装vtk (5.10.0；5.8.0也同样有效)

brew install vtk --python --tcl --examples --qt

...and等待(编译大约需要40分钟)。--qt标志不是严格必要的，但它也没有坏处。

接下来，从http://www.vtk.org/files/release/5.10/vtkdata-5.10.0.tar.gz下载vtk数据，解压缩并让VTK_DATA_ROOT环境变量指向VTKData目录。中运行一些示例

/usr/local/share/vtk/Examples

用python <example>.py启动python示例，用vtk <example.tcl>启动TCL示例。效果非常好，对吧？所以让我们看看梅拉维下一步是怎么搞砸的.

2.4 ETS和mayavi

尽管

pip install mayavi

在某个地方，它似乎会产生比从github安装流血边缘更多的崩溃。获取https://github.com/enthought/ets/raw/master/ets.py并运行

python ets.py clone

克隆ETS git存储库。您只需要apptools、mayavi、pyface、traits和traitsui，如果要从命令行运行mayavi2，则可能需要envisage。因此，删除其他目录并执行

python ets.py develop

这将允许您在mayavi/examples/tvtk和mayavi/examples/mayavi中运行存储库中的一些示例，方法是运行python <example>.py并使用GUI。有许多控制台错误和许多GUI功能不起作用，比如选择LUT表。但希望它不会崩溃。

2.5 matplotlib，ipython

我更喜欢从github那里得到出血的边缘，以便得到scipy和matplotlib。首先使用brew安装所有依赖项。然后

git clone https://github.com/scipy/scipy.git
cd scipy
python setup.py install

git clone https://github.com/matplotlib/matplotlib.git
cd matplotlib
python setup.py install

然后使用pip安装ipython (0.13)。对于qt控制台，首先安装：

pip install pygments
pip install pyzmq

然后

pip install ipython

启动与mayavi一起使用的ipython有几种可能的方法，这取决于谁控制QT事件循环：

• ipython with mlab.show()：Hangs.
• ipython with mlab.show()：Works，但提示符可能变成unresponsive.
• ipython --gui=qt或ipython --pylab=qt：Works，但是“保存”对话框关闭没有mlab.show()的immediately.
• ipython qtconsole：带有mlab.show()：Works.
• ipython qtconsole --gui=qt或ipython qtconsole --pylab=qt：Works.

祝好运!