图形绘制软件

Question

我需要绘制一个由1876年按以下方式组织的集群组成的图表：

962 clusters composed by 1 node
651 clusters composed by 2 nodes
144 clusters composed by 3 nodes
52  clusters composed by  4 nodes
24  clusters composed by  5 nodes
8   clusters composed by 6 nodes
8 clusters composed by 7 nodes
2 clusters composed by 8 nodes
4 clusters composed by 9 nodes
3 clusters composed by 10 nodes
1 cluster composed by  11 nodes
1 cluster composed by  12 nodes
4 clusters composed by 13 nodes
1 cluster composed by  16 nodes
1 cluster composed by  21 nodes
1 cluster composed by  22 nodes
1 cluster composed by  24 nodes
1 cluster composed by  25 nodes
1 cluster composed by  26 nodes
1 cluster composed by  29 nodes
2 clusters composed by 31 nodes
1 cluster composed by  43 nodes
1 cluster composed by  65 nodes
1 cluster composed by  4843953 nodes

我尝试了几个软件，包括pajek、SocNet，但它们似乎更以节点为中心(它们允许您在节点上执行统计和一些高级操作)。相反，--我不关心节点本身--，也不关心它们的连接。--我只想用中的节点来显示这样的集群。

有谁知道有什么软件可以帮助我吗？

这是livejournal的图表

Answer 1

我认为你的问题不会有合理的答案，但我想在这里提供我的2美分：

• 看看如何绘制图的例子，然后重新表述你的问题。
• 一个集群应该如何可视化？大多数集群易于可视化，但具有4.843.953节点的集群是一个杀手。我怀疑和其他人一起想象这个集群是不合适的.
• 到目前为止，我所看到的最好的是可视化图形的来自TowSawyer的软件。但是这个软件有一个很高的价格标签，也许它可以帮助你清楚地知道如何可视化。

当你找到上述评论的答案和细节时，我想会有一种方法使它们形象化。

Answer 2

原则上，Mathematica 8应该能够用它的新图表对象来处理您的问题。我说，“原则上”，因为我很难想象一个拥有近500万节点(或顶点)的集群在屏幕上或纸上打印时会是什么样子。选择合适的GraphLayout将是至关重要的，正如胡中的比较所示：

​

它们是同一幅图(936个顶点)的3幅画，其中最穷的是(当然)在左边。这篇文章包含了一个有225 k个顶点的图的渲染，它的结构有点可辨。

无论如何，它可以以邻接矩阵或边列表等形式处理输入。边可以是指向的，也可以是不指向的。您可以显示和标记所有或部分或没有顶点和边缘。您还可以移除群集(GraphComponents)，单独或组合地显示它们。它还为您提供了各种GraphLayout选项: CircularEmbedding、SpiralEmbedding、HighDimensionalEmbedding、LargeNetwork等。有多种GraphStyles。

有一个名为NeighborhoodGraph的命令，您可能会发现它对于这个庞大的集群很有用。Neighborhoodg，v，n生成一个从顶点v到n步内的所有节点的子图，你也可以通过要求一个具有预定边、顶点或两者的列表的子图来简化事情。

请注意，图中的一些文档将引用Combinatorica，虽然它在许多方面都非常优秀和有用，但在我看来，它并不像version 8 graphs那样精确地呈现图形。

讨论了关于大型图的图布局的一些问题，并讨论了这里。还有一个关于绘制大图的所以讨论，其中比较了各种软件解决方案。

Answer 3

试试AT&T的图文。