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社区首页 >问答首页 >BioPython字母表汤

BioPython字母表汤
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Stack Overflow用户
提问于 2011-05-17 06:28:28
回答 1查看 696关注 0票数 1

在这里,我试图创建一个程序,它使用Biopython包Alphabet和字母表模块IUPAC将列出的类的字母写出到一个名为alphabetSoupOuput.txt的文件中。

  1. ThreeLetterProtein
  2. IUPACProtein
  3. unambiguous_dna
  4. ambiguous_dna
  5. ExtendedIUPACProtein
  6. ExtendedIUPACDNA

每组字母应写到输出文件中的单行,字母应用逗号分隔。每组字母前面的行应该包含一个标签,该标签描述字母,并在该行的第一个位置有一个#。

三字母蛋白

Ala,Asx,Cys,.,Glx

蛋白质字母A,C,D,E,.,Y

我该怎么做?

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2011-05-18 10:07:04

这一点在BioStar StackExchange上得到了回答:

http://biostar.stackexchange.com/questions/8370/working-with-alphabet-soup

http://biostar.stackexchange.com/questions/8371/extracting-data-from-classes-in-python

票数 1
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/6027064

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