R包中的htmlParse()分段错误：“内存未映射”

Question

我使用的是R2.11.1和XMLPackage3.1-0，当我遇到一个分段错误时，我正在看R2GoogleMaps的一个示例。

#library(RJSONIO)
library(R2GoogleMaps)
library(XML)
#library(RCurl)

load("b.rda") # find in the sampleDocs folder in source file of R2GoogleMaps

center = c(mean(range(b$lat)), mean(range(b$long)))
code = addOverlay(gpolyline(b))

d = googleMapsDoc(code, center, zoom = 11, dim = c(750, 700), file = "simplePolyline.html")

下面是一个容易复制的代码，它得到了相同的错误：

> library(XML)
> a <- htmlParse("http://bm2.genes.nig.ac.jp/RGM2/R_current/library/XML/man/xmlTreeParse.html")
> a

 *** caught segfault ***
address 0x55aa44, cause 'memory not mapped'

Traceback:
 1: .Call("RS_XML_dumpHTMLDoc", doc, as.integer(indent), as.character(encoding),     as.logical(indent), PACKAGE = "XML")
 2: saveXML(from)
 3: saveXML(from)
 4: asMethod(object)
 5: as(x, "character")
 6: cat(as(x, "character"), "\n")
 7: print.XMLInternalDocument(<pointer: 0x1016363f0>)
 8: print(<pointer: 0x1016363f0>)

Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace
Selection: 1
aborting ...

Process R segmentation fault at Sat Jul 31 22:07:02 2010

问题似乎还在于对saveXML()文件执行htmlParse()。

当我编写另一段使用htmlParse()的代码时，我不记得遇到过这个问题(尽管我不记得是否显式地调用了htmlParse()对象)。所以我不完全确定这是不是最近的问题。当时和现在(我还记得)的唯一区别是，我已经从源代码中安装了许多OmegaHat软件包。

我很好奇是否还有其他人犯了这个错误。为了探索原因是否是我的笔记本电脑，我已经重新启动和升级我的操作系统作为一个基本步骤。有什么问题吗？谢谢。

编辑：只供参考：

> sessionInfo()
R version 2.11.1 (2010-05-31) 
x86_64-apple-darwin9.8.0 

locale:
[1] C

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  grid      methods  
[8] base     

other attached packages:
[1] XML_3.1-0     digest_0.4.2  reshape_0.8.3 plyr_0.1.9    proto_0.3-8  

loaded via a namespace (and not attached):
[1] ggplot2_0.8.7

Answer 1

我认为，几乎从定义上说，分割错误构成了一个错误。你的例子对我有用(见下文)。

我将(a)确保您有最新版本的XML，并且错误仍然发生在那里；(b)与XML包的维护人员联系(尝试)

维护者(“XML”)，并提供您的示例和sessionInfo()的结果

祝好运。

=============

库(XML) <- htmlParse("当前/库/XML/man/xmlTreeParse.html") sessionInfo() R版本2.11.1 (2010-05-31) i 486-pc-linux-gnu

地区:1 LC_CTYPE=en_en.US.UTF 8 LC_NUMERIC=C

3 LC_TIME=en_en.US.UTF 8 LC_COLLATE=en_en.US.UTF 8

5 LC_MONETARY=C LC_MESSAGES=en_US.UTF-8

7 LC_纸张=en_LC.US.UTF 8 LC_NAME=C

9 LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C

11 LC_测量=en_11.US.UTF 8 LC_IDENTIFICATION=C

附加的基本包:1个stats图形、grDevices实用数据集、网格方法

8个基地

其他附加软件包:1 XML_3.1-0 reshape_0.8.3 plyr_1.0.3 proto_0.3-8

通过命名空间加载(但未附加)：1 ggplot2_0.8.8