R包安装

Question

我基本上有两个问题。

1. 如何定位正在运行的默认Rprofile？我还没有设置一个Rprofile，所以我不知道它是从哪里运行的。
2. 我正在尝试使用这个命令安装几个软件包(在主终端中执行了SUDO之后).

install.packages("RODBC","/home/rama/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.9")

我得到了一个错误，它说：

‘/home/rama/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.9/00LOCK’错误:未能锁定目录‘/home/rama/r/i 486-pc-linux-gnu-库/2.9’，请尝试删除

下载的软件包在‘/tmp/RtmpkzDMVU/ downloaded _ packages’警告消息中:在install.packages中(“RODBC”，“/home/rama/r/i 486-pc-linux-gnu-”)：安装包'RODBC‘具有非零退出状态。

Answer 1

对你的问题有几点评论：

1. 看help(Startup)。您可能正在运行$R_HOME/etc/Rprofile，在Ubuntu和Debian上也可以使用它作为/etc/R/Rprofile，因为我们创建了连接它们的软链接，您有一个空的$R_HOME/etc/Rprofile.site和~/.Rprofile可供玩。
2. 作为开始，在锁文件上做ls -l，并看到它在那里。如果是这样，如果您没有其他R进程运行，请删除。重新启动包install.
3. RODBC需要一个ODBC库的开发头，所有这些--同样，对于Debian / Ubuntu，您只需说sudo apt-get install r-cran-rodbc。如果您运行另一个发行版，看看它们是否有RODBC prepackaged.
4. Regarding ~/.Rprofile，您可以向this earlier StackOverflow question.

学习一些可能的技巧和技巧。

Answer 2

关于您的软件包安装，我认为问题是"/home/rama/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.9/00LOCK".只要rm这个dir和安装将工作。

中文参考文献：http://cos.name/cn/topic/108555#post-239310

Answer 3

谢谢你的回复。那真的很有帮助！我用sudo apt安装了我的RODBC包。真是无痛啊。但是，对于Rprofile正在运行的问题，我仍然有点困惑。我确实在运行Ubuntu的快感。

当我执行whereis命令时，我得到以下信息。

R: /usr/bin/R /etc/R /usr/lib/R /usr/local/lib /usr/share/R /usr/share/man/man 1/r1.gz

在/etc/R以下

ldpaths Renviron Renviron.site知识库Rprofile.site

如果我cd到/usr/lib/R/etc，我有

ldpaths Renviron Renviron.site知识库Rprofile.site

1)我的问题是，其中哪一个被用来运行R？

2)当我执行sudo apt install r-cran-rodbc时，软件包在哪里安装？

3)我在/ home /rama/r/i 486-pc-linux-gnu-library/2.9有一个主文件夹，我的生物导体包都在这里。如何在这里安装sudo apt软件包？(？.Rprofile)是否有必要？