对于R的最成熟的稀疏矩阵包？

Question

对于R，至少有两个稀疏矩阵包，我正在研究这些包，因为我处理的数据集太大，太稀疏，无法用密集的表示形式存储在内存中。我想要基本的线性代数例程，加上能够轻松地编写C代码来操作它们。哪个图书馆最成熟，最适合使用？

到目前为止我发现

• 矩阵有许多反向依赖，这意味着它是最常用的。
• SparseM没有那么多反向设备。
• 各种图库可能都有自己的(隐式)版本；例如艾格图和网络 (后者是状态网的一部分)。这些东西对我的需要来说太专业了。

有人有这方面的经验吗？

从搜索RSeek.org的角度来看，矩阵包似乎是最常见的。我经常认为CRAN任务视图相当权威，多元任务视图提到了矩阵和SparseM。

Answer 1

矩阵是最常见的，也是刚刚被接受的R标准安装(截至2.9.0)，所以应该是广泛可用的。

基矩阵：https://stat.ethz.ch/pipermail/r-announce/2009/000499.html

Answer 2

在我的经验中，矩阵是你提到的最受支持和最成熟的软件包。它的C架构也应该公开得相当好，并且相对简单易用。

Answer 3

稀疏矩阵上的log(x)是个坏主意，因为log(0)没有定义，稀疏矩阵的大多数元素都是零。

如果您只想获取非零元素的日志，请尝试转换为三元稀疏表示，并获取这些值的日志。