XGBoost在创建XGBoost.DMatrix时杀死内核

Question

我的jupyter笔记本内核在尝试使用以下方法创建XGBoost DMatrix时没有错误消息就死了：

# Create the XGBoost DMatrix
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train)

我尝试过以下几种方法，但没有任何运气：

• 只处理数据集的50%或25%
• 根据这条线删除liBiop5.dylib
• 将import os os.environ['KMP_DUPLICATE_LIB_OK']='True'包括在笔记本的顶部，如这条线所示
• 用brew install libomp更新libomp
• 重新安装我的mambaforge包管理器

我不知道该到哪里去看看。任何帮助/输入都非常欢迎。

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在本地使用xgboost时再现错误的MRE：

# create dummy data
d = {
  'y': [1, 0, 0, 1], 
  'x1': [1, 2, 3, 4],
  'x2': [5, 6, 7, 8],
  'x3': [9, 0, 1, 2]}

df = pd.DataFrame(data=d)
 
# create train/test splits
X, y = df.iloc[:, 1:], df["y"]
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(
X, y, test_size=0.25, shuffle=True, random_state=2)

# Create the XGBoost DMatrix
dtrain = xgb.DMatrix(X_train, y_train)

我的工作是：

• 2020年M1 Macbook Pro
• Python: 3.9
• XGBoost: 1.4.2
• 熊猫: 1.3.1
• 数字: 1.21.2

注意:我尝试过降低XGBoost的评级。V1.2.0会创建DMatrix，但是在调用xgb.train(params,dtrain)时会出现相同的行为(没有错误消息，内核会死)。

Answer 1

我什么都试过了，也面临着同样的使用，对我起作用的是将libomp的版本降级为11.1.0。

brew uninstall libomp
brew install libomp@11.1.0

然后重新启动朱庇特。